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标题: 最新版的crest缺少xyz2coord工具 [打印本页]

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milliliter    时间: 2025-4-16 22:32
标题: 最新版的crest缺少xyz2coord工具
在参考博文使用Molclus结合xtb做的动力学模拟对瑞德西韦(Remdesivir)做构象搜索》(http://bbs.keinsci.com/thread-16255-1-1.html)中利用crest程序节约xtb批量优化大量结构阶段的耗时,出现下图报错,而crest和xtb文件包中都没有将XYZ文件转换为coord格式的xyz2coord工具。请问各位老师,在哪里能下载xyz2coord工具,或者是否有其他转换为coord格式的软件推荐(Multiwfn中也没有看到这个文件输出格式)?

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Daniel_Arndt    时间: 2025-4-18 10:43
可以参考本论坛的 http://bbs.keinsci.com/thread-10143-1-1.html
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milliliter    时间: 2025-4-25 20:51
Daniel_Arndt 发表于 2025-4-18 10:43
可以参考本论坛的 http://bbs.keinsci.com/thread-10143-1-1.html 。

谢谢老师指点
作者
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Daniel_Arndt    时间: 2025-5-4 10:07
milliliter 发表于 2025-4-25 20:51
谢谢老师指点

其实现在的GFN-xTB、crest都不需要coord这种文件格式了,常用的操作都可以用xyz文件来完成。当然,如果你因为某些特殊目的要用比较早的版本的GFN-xTB的话,那你可能需要coord。




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