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标题: 求助：VASP建模一定要是周期性的吗，我在大盒子里建模进行结构优化和吸附能计算可以吗 [打印本页]

作者
Author: uft 时间: 2025-11-26 10:27
标题: 求助：VASP建模一定要是周期性的吗，我在大盒子里建模进行结构优化和吸附能计算可以吗
我在VASP中结构优化和计算吸附能，这样建模正确吗，是不是上下左右真空层建高一点就可以

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作者
Author: wangnan2256 时间: 2025-11-26 10:38
不一定要是周期性，但是要避免相互作用，要留足够的距离，而且这个模型如果第一层是吸附分子，第二层是基底，基地就太小了。即便你这两层都是基底感觉也有点小了。另外你这个体系不算大，也不一定非要用vasp来做，gaussian也算的动。

作者
Author: 白皛白 时间: 2025-11-26 10:46
VASP可以这样算，但要保证盒子足够大，不同周期之间需保持6~8埃的距离避免相互作用。不过盒子大了算的就会慢很多，所以感觉这样的体系没理由用VASP，CP2K或高斯都算的比VASP快的多的多，结合multiwfn能做的性质计算也更丰富些。

作者
Author: uft 时间: 2025-11-26 10:53

wangnan2256 发表于 2025-11-26 10:38
不一定要是周期性，但是要避免相互作用，要留足够的距离，而且这个模型如果第一层是吸附分子，第二层是基底 ...

好的，谢谢，我的基底是单层石墨烯，主要是想看石墨烯上的羟基对吸附的影响

作者
Author: uft 时间: 2025-11-26 10:55

白皛白发表于 2025-11-26 10:46
VASP可以这样算，但要保证盒子足够大，不同周期之间需保持6~8埃的距离避免相互作用。不过盒子大了算的就会 ...

好的谢谢，那这样的结构能算带隙吗，算出来准确吗

作者
Author: 白皛白 时间: 2025-11-26 14:51

uft 发表于 2025-11-26 10:55
好的谢谢，那这样的结构能算带隙吗，算出来准确吗

可以算，但GGA-PBE泛函常会低估带隙，如果是定性研究或许没问题，因为看的是带隙的变化趋势。但如果要与实验值做对比的话到时候可能需要考虑用metaGGA或者杂化泛函之类的。

作者
Author: sobereva 时间: 2025-11-27 04:00

uft 发表于 2025-11-26 10:53
好的，谢谢，我的基底是单层石墨烯，主要是想看石墨烯上的羟基对吸附的影响

第一性原理程序算石墨烯吸附就老老实实用周期性模型
诸如下文这样截出来的簇模型只适合量子化学程序
18碳环（cyclo[18]carbon）与石墨烯的相互作用：基于簇模型的研究一例
http://sobereva.com/615（http://bbs.keinsci.com/thread-25306-1-1.html）

并且看上文的讨论，弄清楚即便用簇模型，石墨烯的尺寸也至少应该多大

石墨烯本身没有羟基。分清楚氧化石墨烯和石墨烯的差别。

作者
Author: sobereva 时间: 2025-11-27 04:01

uft 发表于 2025-11-26 10:55
好的谢谢，那这样的结构能算带隙吗，算出来准确吗

都是孤立体系了，哪来的带隙

作者
Author: Diotima 时间: 2025-11-27 11:46

uft 发表于 2025-11-26 10:55
好的谢谢，那这样的结构能算带隙吗，算出来准确吗

应该是只能算HOMO-LUMO Gap吧。

作者
Author: zblxyrz 时间: 2025-12-4 00:37
如果不是周期性体系，边缘的结构有时候会出现预期之外的变化，而且你恐怕要用更多的时间去让边缘结构收敛优化，

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