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2429783189 发表于 2026-1-21 01:38 自己在VMD里用查询模式查询你感兴趣的键径的序号 ,下文文末说了 使用Multiwfn+VMD快速地绘制高质量AIM拓扑分析图(含视频演示) http://sobereva.com/445(http://bbs.keinsci.com/thread-11079-1-1.html) |
| 请问老师,VMD拖入AIM分析产生的path.pdb之后,有方法能在VMD中显示所有的键径序号吗,体系太大在Multiwfn里面看得太卡了,使用Multiwfn+VMD快速地绘制高质量AIM拓扑分析图(含视频演示) - 思想家公社的门口:量子化学·分子模拟·二次元您的这篇博文说了VMD中显示所有键临界点序号的方法,但好像没有说显示键径序号的方法。 |
sobereva 发表于 2026-1-15 00:41 感谢老师的回复,我的表述确实有点不清楚,这个问题已经自行解决了。 |
2429783189 发表于 2026-1-14 21:39 “片段1中贡献了70%的D基函数” 这种描述语义不明。是片段1的D基函数对这个NAdO贡献了70%,还是NAdO里面所有D基函数的贡献中这个片段贡献了70%,或是其它什么。我也看不懂你的最终目的 |
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我在使用Multiwfn做周期性进行吸附界面的两个片段间NAdO分析,已经成功得到结果,但目前的问题是NAdO轨道数目较多,而且有八个体系,全部讨论自然不现实,因此想对不同的NAdO轨道做轨道成分分析,得到两个片段上的不同原子基函数产生的贡献,然后再把这些贡献根据轨道NAdO本征值进行加权加和,比如说我得到NAdO轨道α(本征值为1.1)中片段1中贡献了70%的D基函数,片段2贡献了30%的P基函数,我又得到NAdO轨道β(本征值为1.3)中片段1中贡献了78%的D基函数,片段2贡献了22%的P基函数,通过加权计算得到片段1贡献了(1.1*70%+1.3*78%)/(1.1+1.3)的D基函数,片段2贡献了(1.1*30%+1.3*22%)/(1.1+1.3)的P基函数,能否这样来计算出片段1和片段2的总的各类基函数的贡献呢 |
2429783189 发表于 2025-12-16 22:51 这种说法没有普适性,顶多是在极其有限的情况下成立 |
| 请问老师,我在一篇文章中看到以下说法:AIM分析得到的键椭率(Bond ellipticity)可以描述化学键稳定性: ε > 1的值表明键不稳定,而 ε < 1则化学键稳定。但是我在您的博文及帖子中从来没看到过这种说法,只看到可以用来讨论化学键的pi特征,请问老师上面说法是否正确呢?键椭率能否用来考察键的稳定性呢? |
dali 发表于 2025-12-12 00:54 赝Jahn-Teller效应,见此文 https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/jp073207o |
| 有个问题向老师请教,单独一个BaCl2分子计算出来的结构是V形,不是直线形,请问老师用哪种波函数分析方法能解释BaCl2分子的结构是V形的原因? |
dingniu2 发表于 2025-12-10 11:49 P的孤对电子比较肥。可以用Multiwfn计算HELV指数衡量孤对电子体积,具体见手册 |
sobereva 发表于 2025-12-10 02:06 谢谢老师!请问老师,如果想要用波函数分析方法去解释PF3比NF3键角小,有哪些波函数分析方法可以用?谢谢老师!!! |
dingniu2 发表于 2025-12-10 01:14 往往可以比较 当前说明P的孤对电子分布得更弥散 |
15670538028 发表于 2025-12-9 22:17 取决于研究了什么性质,和LUMO有什么关联,以及文中怎么说的 如果仅仅是极个别原子带来的杂质能级,对体系的性质可能影响微弱,不值得拿那个峰过度说事 |
| 请问老师,不同分子之间的ELF平面填色图的高定域区域的大小可以进行比较吗?如果可以,定域区域大能说明什么?例如NF3和PF3相比,P的孤对电子定域区域比N孤对电子定域区域大,该如何解释?谢谢老师! |
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