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发布时间: 2018-6-5 10:16
正文摘要:虽然本论坛有专门的Multiwfn板块，但还是老有人问Multiwfn问题的时候跑到量化版的“简单量子化学问题答疑专帖”（http://bbs.keinsci.com/thread-33965-1-1.html），这样不好。 遂这里专门开一个“简单Multiwfn使 ... |
hzfish 发表于 2024-11-15 21:29 r2SCAN-3c的波函数原理上可以用于这种分析 Hirshfeld原子电荷为正，和这个原子附近有没有负值的表面极值点是两回事。画个表面静电势填色图，是什么情况一目了然。 原子电荷衡量的是原子的整体带电情况，并不体系表面静电势局部分布如何。比如存在sigma-hole的卤素原子，Hirshfeld电荷一般为负，而sigma-hole区域一般静电势为正 |
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绘制带极值点的静电势着色的分子范德华表面图，对泛函和基组选择有要求吗？ 我用r2SCAN-3c计算得到的molden，绘制图，Hirshfeld charge为正值的上方的极值点为负值。 另外surfanalysis.pdb文件中该正值的地方有负值，该负值的地方有正值。 |
sobereva 发表于 2024-10-4 00:28 收到，谢谢老师的耐心解答！ |
Nankaier 发表于 2024-10-3 11:50 不需要非得一致 而且DFT-D色散校正不影响概念密度泛函相关的量的结果，因为结构没变化 基组用def2系列最省事，支持几乎全周期表，第五周期开始直接就是赝势基组 |
| 各位老师，484博文中通过使用Multiwfn超级方便地计算出概念密度泛函理论中定义的各种量，结构优化时使用了赝势基组、溶剂模型以及色散矫正，那么在输入计算单点任务的关键词时，需要考虑需赝势基组、溶剂模型以及色散矫正吗？如果需要的话，那么要按照什么格式输入呢？ |
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kimariyb 发表于 2024-9-20 11:13 空间位阻分析这种事都得结合实际体系实际问题来说，情况各有不同 没前提的情况下只能说可行的做法包括IGMH/IRI分析、NBO的steric分析、考察能量分解中的交换互斥项，以及设计一些特殊的模型讨论（参考J. Am. Chem. Soc. 2021, 143, 49, 20837–20848） |
sobereva 发表于 2024-8-31 06:05 卢老师，如果我还想定量分析 N 原子位点的空间位阻，有没有什么好的方法呢 |
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我自己手动输入200 3 180-181 2 1能出来，但是用这个就txt文件就报错，手动输入可以出来cue文件，放入VMD，改了路径，也不出orb |
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kimariyb 发表于 2024-8-30 12:13 算N附近的静电势极小点（主要由孤对电子导致和贡献）的静电势数值，越负说明越亲核，参考下文 使用Multiwfn对静电势和范德华势做拓扑分析精确得到极小点位置和数值 http://sobereva.com/645（http://bbs.keinsci.com/thread-30769-1-1.html） 也可以算原子电荷，但原理上上面的方法更好，因为更具体到作用位点上 |
| 卢老师好，请问如果我想考察一系列含 N 的芳杂环对一个 Ir 金属配合物的亲核能力，可以采用什么方法。可不可以类似于考察价层电子密度，将 pi 轨道归零，计算 N 的 sigma 电子 |
sobereva 发表于 2024-8-21 12:02 明白，请问老师有推荐的软件吗 |
cyan24 发表于 2024-8-21 11:47 Multiwfn不支持盆间面积分 |
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老师您好， 文献（ Macchi, P.; Sironi, A. Chemical Bonding in Transition Metal Carbonyl Clusters: Complementary Analysis of Theoretical and Experimental Electron Densities. Coordination Chemistry Reviews 2003, 238–239, 383–412.）使用了一个参数 electron density integrated over the interatomic surface （IAS） separating atoms A and B来分析金属键，使用Multiwfn做电子密度盆分析的时候没有看到这个选项，请问有什么办法可以计算出该数值？感谢感谢 |
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