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如何判断反应是否有过渡态?

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发布时间: 2018-7-5 22:18

正文摘要:

老师在帖子里提到过: 并非所有反应途径都需要越过势垒,这类反应在很低的温度下就能发生,盲目找它们的过渡态是徒劳的。常见的包括自由基结合,比如甲基自由基结合为乙烷;自由基向烯烃加成,比如甲基自由基向乙烯 ...

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嘤嘤嘤 发表于 Post on 2023-3-14 20:59:14
wzkchem5 发表于 2023-3-14 17:49
自己用谷歌学术搜一下radical rebound

感谢老师的回复,我搜了一下,好多带有此类关键词的机理文章,我再好好看看。
wzkchem5 发表于 Post on 2023-3-14 17:49:20
嘤嘤嘤 发表于 2023-3-14 10:44
想请问下,什么是自由基反弹过程啊?

自己用谷歌学术搜一下radical rebound
嘤嘤嘤 发表于 Post on 2023-3-14 17:44:03
大头攒毛 发表于 2023-3-8 10:54
你好,你也算氢提取反应吗?
如果只是单纯的氢提取反应,应该是有过渡态的
我这里一直有个疑问,自由基 ...

想请问下,什么是自由基反弹过程啊?
wzkchem5 发表于 Post on 2023-3-8 15:59:40
大头攒毛 发表于 2023-3-8 03:54
你好,你也算氢提取反应吗?
如果只是单纯的氢提取反应,应该是有过渡态的
我这里一直有个疑问,自由基 ...

一般有,但不排除个别情况下没有
大头攒毛 发表于 Post on 2023-3-8 10:54:23
嘤嘤嘤 发表于 2021-9-14 21:08
老师,目前我遇到了类似问题。我找到了TS,也进行了IRC。但是发现TS能量低于反应物,把IRC的一段作为中间 ...

你好,你也算氢提取反应吗?
如果只是单纯的氢提取反应,应该是有过渡态的
我这里一直有个疑问,自由基反弹过程有过渡态吗?
嘤嘤嘤 发表于 Post on 2021-9-19 15:48:06
老师,我检查了TS和IM的波函数稳定性,发现IM的波函数不稳定,但是稳定后重新计算发现能量越来越低,然后用增大了基组用CCSD(t)算,发现正常了。所以就像你说的直接用E就行是吧?但是,你这个反应路径用E的话,其他的呢?难道之前算的单重态和三重态都要重新优化用E吗?
sobereva 发表于 Post on 2021-9-16 06:57:43
嘤嘤嘤 发表于 2021-9-15 10:56
我先是在单重态下找到了这个氢抽屉的反应路径,然后在单重态的基础上找到了三重态的TS,然后优化完没有报 ...

E+ZPE没有实际意义,要么图省事用E,要么图化学意义用G(T)
对于特定自旋多重度、能量和opt/IRC任务相同时,如果TS低于极小点能量,要么TS和这个极小点不直接相连,要么犯了低级错误,或者有的结构没收敛到稳定波函数。老生常谈的问题
嘤嘤嘤 发表于 Post on 2021-9-15 10:56:35
sobereva 发表于 2021-9-15 01:37
说清楚能量怎么算的
如果计算能量的级别和产生IRC、结构优化完全是相同级别,不可能有这种现象(要么是 ...

我先是在单重态下找到了这个氢抽屉的反应路径,然后在单重态的基础上找到了三重态的TS,然后优化完没有报错,虚频振动方向符合反应机理,进行IRC后两端也符合产物和反应物,IRCpath就是我昨天上传的那个,整理数据发现ZPE+E的能量,TS是低于反应物的,于是将IRC的一端作为中间体整体优化,并计算了单点能,整理数据后发现,TS的E+ZPE还是低于中间体的能量的,通过观察结构发现,二者结构相差不大。而且通过IRC也能看出TS和中间体的能量相差不多的
sobereva 发表于 Post on 2021-9-15 01:37:41
嘤嘤嘤 发表于 2021-9-14 21:08
老师,目前我遇到了类似问题。我找到了TS,也进行了IRC。但是发现TS能量低于反应物,把IRC的一段作为中间 ...

说清楚能量怎么算的
如果计算能量的级别和产生IRC、结构优化完全是相同级别,不可能有这种现象(要么是搞错了,要么其中有的任务没收敛到稳定波函数)
嘤嘤嘤 发表于 Post on 2021-9-14 21:09:57
sobereva 发表于 2021-3-19 18:08
去试图找过渡态,摆各种可能的初猜,用合理的关键词

E:\1gaosi这是IRCpath

~994W%AYW8BJ1XAT@2~O(8V.png (26.08 KB, 下载次数 Times of downloads: 96)

~994W%AYW8BJ1XAT@2~O(8V.png
嘤嘤嘤 发表于 Post on 2021-9-14 21:08:48
sobereva 发表于 2021-3-19 18:08
去试图找过渡态,摆各种可能的初猜,用合理的关键词

老师,目前我遇到了类似问题。我找到了TS,也进行了IRC。但是发现TS能量低于反应物,把IRC的一段作为中间体进行优化,没有报错,但是能量还是高于TS,他俩结构相差不大,此时能认为这个氢抽提反应没有过渡态吗?
sobereva 发表于 Post on 2021-3-19 18:08:10
嘤嘤嘤 发表于 2021-3-19 09:42
老师请问怎么去计算检验啊?

去试图找过渡态,摆各种可能的初猜,用合理的关键词
嘤嘤嘤 发表于 Post on 2021-3-19 09:42:02
sobereva 发表于 2018-7-6 01:48
不确定的时候就去计算进行检验,这样万一审稿人问你,心里也有数

PS:文中用的泛函很荒唐,严重不适合此 ...

老师请问怎么去计算检验啊?
sobereva 发表于 Post on 2018-7-13 21:07:10
木子之玉ccc 发表于 2018-7-12 10:58
请详细描述如何进行这种操作?

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