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求垂直孔洞轴心截面的长边和短边长度

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发布时间: 2018-8-16 21:01

正文摘要:

阅读了sob老师的文章:使用Multiwfn可视化分子孔洞并计算孔洞体积http://sobereva.com/408。希望能够求出垂直孔洞轴心的切出来的截面的长轴和短轴各有多长,不知道能不能实现?谢谢各位老师

回复 Reply

sobereva 发表于 Post on 2018-8-17 13:47:08
我刚才又对程序作了更新,目前可以把边缘格点导出成pdb文件,在VMD里随意测量,例如


相应地,之前的帖子http://bbs.keinsci.com/thread-9331-1-1.html也已经更新了

sobereva 发表于 Post on 2018-8-17 10:46:25
我刚刚更新了Multiwfn,去主页上重新下载3.6(dev)版,此版本对域进行积分,会有以下输出
Volume:  317.232000 Bohr^3  (   47.008943 Angstrom^3 )
Average:    0.1000000000E+01
Maximum:    0.1000000000E+01   Minimum:    0.1000000000E+01

Position statistics for coordinates of domain points (Angstrom):
X minimum:   -2.7823  X maximum:    3.1445  Span:    5.9268  
Y minimum:   -2.6823  Y maximum:    2.6095  Span:    5.2918
Z minimum:   -3.1770  Z maximum:    3.9140  Span:    7.0910  <-此即Z方向孔洞的长度

如果这不是你需要的数据,最好能在图上标注一下具体需要哪个距离

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