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关于量化计算中构象的问题

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发布时间: 2018-12-19 09:30

正文摘要:

本帖最后由 409407227 于 2018-12-19 09:48 编辑 文献中说:Further we investigated a five-coordinated Al(III) fluorocomplex paired with two Li+. Three different conformations (local energy minima) wer ...

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FENGXIANGYANG 发表于 Post on 2021-12-27 10:37:13
sobereva 发表于 2021-12-25 20:09
稳定性有很多类型,论坛上有过无数次讨论,用首页全文搜索框搜索
热力学角度对比稳定性通常用自由能,怎 ...

感谢社长解答!
sobereva 发表于 Post on 2021-12-25 20:09:07
FENGXIANGYANG 发表于 2021-12-24 15:18
您好 我想问一下稳定性一般是比较哪一项能量,是比较Sum of electronic and thermal Free Energies,还是 ...

稳定性有很多类型,论坛上有过无数次讨论,用首页全文搜索框搜索
热力学角度对比稳定性通常用自由能,怎么算仔细看
使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据
http://sobereva.com/552http://bbs.keinsci.com/thread-17494-1-1.html
电子能量和自由能完全是两码事,仔细看Shermo程序手册附录,了解量子化学研究涉及的热力学的基本常识
FENGXIANGYANG 发表于 Post on 2021-12-24 15:18:52
409407227 发表于 2018-12-19 11:40
谢谢您,您的意思是画好初猜结构,配棱配面组合一下,算一下单点能,能量最低的几个就是最稳定的吧:victo ...

您好 我想问一下稳定性一般是比较哪一项能量,是比较Sum of electronic and thermal Free Energies,还是优化步骤最后一个SCF Done:后的电子能量?
409407227 发表于 Post on 2018-12-21 10:16:30
liyuanhe211 发表于 2018-12-19 11:42
说了“画好初猜【优化】”

您好,我想在请教您一个问题:做柔性扫描时,可不可以不在冗余内坐标下进行,写成opt=cartesian?在扫描过程中涉及到键的断裂,需不需要加个guess(always)关键词呢?谢谢您。
409407227 发表于 Post on 2018-12-20 12:04:18
liyuanhe211 发表于 2018-12-19 11:42
说了“画好初猜【优化】”

谢谢您
liyuanhe211 发表于 Post on 2018-12-19 11:42:50
409407227 发表于 2018-12-19 11:40
谢谢您,您的意思是画好初猜结构,配棱配面组合一下,算一下单点能,能量最低的几个就是最稳定的吧:victo ...

说了“画好初猜【优化】”
409407227 发表于 Post on 2018-12-19 11:40:45
liyuanhe211 发表于 2018-12-19 11:26
有很多构象搜索的办法,要构象搜索的话此处可以先搜索AlF5的构象,然后最傻的在球面上随机加Li优化应该也比 ...

谢谢您,您的意思是画好初猜结构,配棱配面组合一下,算一下单点能,能量最低的几个就是最稳定的吧
liyuanhe211 发表于 Post on 2018-12-19 11:26:18
有很多构象搜索的办法,要构象搜索的话此处可以先搜索AlF5的构象,然后最傻的在球面上随机加Li优化应该也比用扫描效率高。

不过这里作者找到的构象没有什么奇怪的想不到的极小点,无非是三角双锥和四角锥、再和配棱、配面组合一下,完全可以直接猜出来,画好初猜优化就完了。

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