求助运行gmx gangle命令出现 Segmentation fault (core dumped)

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发布时间: 2019-6-24 11:17

命令如下：gmx gangle -f mapped.xtc -n bonded.ndx -g1 angle -group1 -oav -oall -oh group选择0， Ctrl-D 后出现Segmentation fault (core dumped) 请问是哪里出错了呐？

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万年流星 发表于 Post on 2019-6-25 09:36:57

sobereva 发表于 2019-6-25 03:56
我从来不用这个命令，也没感觉这个命令有什么价值（通过自写VMD脚本可以轻易实现），不过貌似是ndx文件定义 ...

我正在做Martini粗粒化，需要用这个命令进行映射，我在检查下文件看看

sobereva 发表于 Post on 2019-6-25 03:56:58

我从来不用这个命令，也没感觉这个命令有什么价值（通过自写VMD脚本可以轻易实现），不过貌似是ndx文件定义的问题。诸如只保留前三个原子就能正常运行

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