计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

Dmol3过渡态搜索时出现多个虚频该如何处理?

查看数: 14716 | 评论数: 12 | 收藏 Add to favorites 2
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
发布时间: 2019-6-27 15:39

正文摘要:

请问各位老师,Dmol3过渡态搜索时出现多个虚频该如何处理?能否将过渡态搜索得到的.xsd文件直接进行TS opt, 计算时出现:“No normal mode information could be found on the model. Please ensure that a normal ...

回复 Reply

lywbanner 发表于 Post on 2025-3-16 00:28:19
AJ86 发表于 2019-6-29 19:23
好的,非常感谢您

这些虚频都在一个xtd文件里,如何选择性保留啊?
ZKW1005 发表于 Post on 2020-9-15 17:12:01
战泽天 发表于 2019-10-30 12:49
您好,我现在也在做过渡态搜寻,对过渡态搜寻得到的结构进行频率计算后出现多个虚频,请问是对选择的虚频 ...

我也想知道是怎样操作的
ZKW1005 发表于 Post on 2020-9-15 17:11:32
您好,打扰您一下。请问就是在做DMOL3过渡态搜索的时候出现多个虚频如何消去多的虚频。在过渡态搜索的时候在勾选频率,在搜索的结果中查看虚频的个数,这样操作是不是正确?
战泽天 发表于 Post on 2019-10-30 12:49:40
zorow 发表于 2019-6-27 17:01
算过渡态时候性质里有没有勾选频率?没有的话要先做个单点能计算性质勾选频率,然后才能做过渡态优化

您好,我现在也在做过渡态搜寻,对过渡态搜寻得到的结构进行频率计算后出现多个虚频,请问是对选择的虚频轨迹做TS search 然后TS op消除虚频,还是对原来的TS search得到的xsd做TS op呢?
AJ86 发表于 Post on 2019-6-29 19:23:06
zorow 发表于 2019-6-28 08:35
不一致的轨迹文件不保留,只保留一致的轨迹文件,然后对TS search得到的结构做TS opt

好的,非常感谢您
zorow 发表于 Post on 2019-6-28 08:35:11
AJ86 发表于 2019-6-27 22:29
不一致的话,就对该频率下的结构进行TS opt吗?

不一致的轨迹文件不保留,只保留一致的轨迹文件,然后对TS search得到的结构做TS opt
AJ86 发表于 Post on 2019-6-27 22:29:13
zorow 发表于 2019-6-27 21:22
看动画的振动方向,哪个和你的反应一致就保留哪个

不一致的话,就对该频率下的结构进行TS opt吗?
zorow 发表于 Post on 2019-6-27 21:22:53
AJ86 发表于 2019-6-27 20:24
是指对某个频率做一个Animation吗?我计算的过渡态有6个虚频,不知道该对哪个频率处理

看动画的振动方向,哪个和你的反应一致就保留哪个
AJ86 发表于 Post on 2019-6-27 20:24:13
zorow 发表于 2019-6-27 20:07
应该先对得到的xsd文件做一下vibrational analysis,然后再做TS opt

是指对某个频率做一个Animation吗?我计算的过渡态有6个虚频,不知道该对哪个频率处理
zorow 发表于 Post on 2019-6-27 20:07:05
AJ86 发表于 2019-6-27 17:21
谢谢回复。算过渡态时勾选了频率,然后我用搜索得到的.xsd文件进行TS opt就出现上面的问题了

应该先对得到的xsd文件做一下vibrational analysis,然后再做TS opt
AJ86 发表于 Post on 2019-6-27 17:21:28
zorow 发表于 2019-6-27 17:01
算过渡态时候性质里有没有勾选频率?没有的话要先做个单点能计算性质勾选频率,然后才能做过渡态优化

谢谢回复。算过渡态时勾选了频率,然后我用搜索得到的.xsd文件进行TS opt就出现上面的问题了
zorow 发表于 Post on 2019-6-27 17:01:47
算过渡态时候性质里有没有勾选频率?没有的话要先做个单点能计算性质勾选频率,然后才能做过渡态优化

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-17 05:56 , Processed in 0.211568 second(s), 31 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list