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大分子的UV-Vis光谱计算问题

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发布时间: 2019-8-14 06:35

正文摘要:

目前在用ORCA做大分子的紫外光谱计算,体系是一个蛋白质二聚体,276个原子,有共轭长链也有局部负电荷,主要有两个问题想请教一下 一是第一步在几何优化时我先用了B97-3c/def2-mTZVP,后续还要用这个配置进行后振 ...

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sobereva 发表于 Post on 2019-8-17 15:31:13
severus 发表于 2019-8-16 22:20
谢谢sob老师,还有一个问题想请教一下,就是我inp文件里写的%pal nprocs 6 end,一开始监控top也确实是六 ...

没见过这种情况
sobereva 发表于 Post on 2019-8-16 07:01:52
severus 发表于 2019-8-16 05:23
For many properties (but not necessarily for geometries), more accurate results are usually given  ...

够。而且未必优化得动
不需要
severus 发表于 Post on 2019-8-16 05:23:28
sobereva 发表于 2019-8-15 08:01
B97-3c标配的不是def2-mTZVP。你看原文就知道。用B97-3c的时候也绝对不能额外再写基组。你写的其它很多关 ...

For many properties (but not necessarily for geometries), more accurate results are usually given by the
hybrid density functionals that incorporate part of the HF exchange.

想问一下sob老师怎么看待manual里的这段话,如果只是为了,优化基态结构进行后续的激发态计算的话,对这种300个原子左右的体系用B97-3c足够吗,单体里有段氨基酸,有必要B97-3c优化完继续换带弥散的基组来优化结构吗(比如B3LYP+D3/ma-def2-TZVP),目前优化起来感觉还是挺吃力的,要等很久
sobereva 发表于 Post on 2019-8-15 08:01:41
severus 发表于 2019-8-14 23:14
B97-3c的基组就是def2-mTZVP啊,我以为关键词还要把基组加上就带上了

B97-3c标配的不是def2-mTZVP。你看原文就知道。用B97-3c的时候也绝对不能额外再写基组。你写的其它很多关键词也都是多余的。不会用的话就直接用Multiwfn产生输入文件避免犯低级错误:
详谈Multiwfn产生ORCA量子化学程序的输入文件的功能
http://sobereva.com/490http://bbs.keinsci.com/thread-13560-1-1.html

B97-3c不适合算激发态,该用什么仔细看
乱谈激发态的计算方法
http://sobereva.com/265http://bbs.keinsci.com/thread-415-1-1.html

直接算起来太吃力的话就用sTDA,Multiwfn可以直接产生ORCA的sTDA的输入文件,算这样大小体系毫无压力
severus 发表于 Post on 2019-8-14 23:14:59
biogon 发表于 2019-8-14 13:19
B97-3c自带基组为什么又要加上def-mTZVP。SOSCF手册里说了稳健性不够好

B97-3c的基组就是def2-mTZVP啊,我以为关键词还要把基组加上就带上了
我本是个娃娃 发表于 Post on 2019-8-14 14:08:38
try to use sTDA after optimization
http://bbs.keinsci.com/thread-5233-1-1.html
biogon 发表于 Post on 2019-8-14 13:19:48
B97-3c自带基组为什么又要加上def-mTZVP。SOSCF手册里说了稳健性不够好
severus 发表于 Post on 2019-8-14 06:38:00
考虑到阴离子的问题第一次优化时我是用的B3LYP+D3/ma-def2-TZVP的组合,但实在难以收敛就先减小了去掉了弥散函数的部分

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