量化结构优化中芳香环上的NH2与环非平面的问题

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发布时间: 2019-10-10 14:31

本帖最后由 enthalpy 于 2019-10-10 14:35 编辑大家好，向大家请教一个量化优化小分子的问题，该分子的结构类似与鸟嘌呤（G base，见图）。所用软件为G-09RevE，计算参数为opt b3lyp/cc-pVTZ scrf=(smd,solvent ...

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enthalpy 发表于 Post on 2019-10-18 12:57:57

Daniel_Arndt 发表于 2019-10-13 03:06
楼主不会是想算RESP电荷吧？

你猜得对，我的确是要算RESP。

enthalpy 发表于 Post on 2019-10-18 12:56:03

sobereva 发表于 2019-10-10 15:10
cc-pVTZ别给普通泛函用
改用更合理的M06-2X/def2-TZVPP再次优化，如果还是这样，说明真实情况就是如此

不好意思，现在才更新。按照sob老师的建议，我重新优化了结构。从新结果看，该分子的芳香环上的NH2的确不与环共平面。再次谢谢sob老师。

Daniel_Arndt 发表于 Post on 2019-10-13 03:06:38

楼主不会是想算RESP电荷吧？

enthalpy 发表于 Post on 2019-10-10 17:10:42

谢谢sob老师！根据你的建议，我试试看。

sobereva 发表于 Post on 2019-10-10 15:10:10

cc-pVTZ别给普通泛函用
改用更合理的M06-2X/def2-TZVPP再次优化，如果还是这样，说明真实情况就是如此

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