计算化学公社»论坛首页 › 理论与计算化学 (Theoretical and Computational Chemistry) › 波函数分析与Multiwfn (Wavefunction Analysis & Multiwfn) › 用Hirshfeld电荷和信息增益研究亲电性和亲核性

用Hirshfeld电荷和信息增益研究亲电性和亲核性

查看数: 34553 | 评论数: 20 | 收藏 Add to favorites 14

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

帖子模式

sobereva

发布时间: 2014-11-1 18:41

正文摘要:

用Hirshfeld电荷和信息增益研究亲电性和亲核性Studying electrophilicity and nucleophilicity using Hirshfeld charge and information gain Sobereva@北京科音 2014-Nov-1 对于化学体系，Shannon ...

回复 Reply

sobereva 发表于 Post on 2021-6-24 01:09:25

945129408 发表于 2021-6-23 22:59
用静电势考察亲核试剂的亲核位点是不是也是糟糕选择，而应该用Hirshfeld电荷

往往是，但不一定。参考

Comparative study on the methods for predicting the reactive site of nucleophili.pdf (1.89 MB, 下载次数 Times of downloads: 9)

945129408 发表于 Post on 2021-6-23 22:59:18

用静电势考察亲核试剂的亲核位点是不是也是糟糕选择，而应该用Hirshfeld电荷

945129408 发表于 Post on 2021-6-23 22:56:21

本帖最后由 945129408 于 2021-6-23 22:57 编辑

静电势去考察亲核试剂的亲核位点是不是也是糟糕的选择？

sobereva 发表于 Post on 2015-7-1 11:04:02

xieyi 发表于 2015-7-1 09:35
请问Sob老师，我的分子带有C H O，是不是遵循帖子所说的线性关系？亲核亲电能不能用Hirshifeld来预测？我 ...

不光看元素，也看成键类型。帖子提到，同样是氮，在不同化学环境下线性关系不同。你可以先试试。
这类问题最鼓励的就是用Hirshfeld电荷，这类问题不鼓励用NPA电荷。

xieyi 发表于 Post on 2015-7-1 09:35:32

sobereva 发表于 2015-5-26 22:32
文中只是全部计算时用scrf模型表现这种溶剂。
这种低极性溶剂对反应位点判断是不会有什么影响的，定量数 ...

请问Sob老师，我的分子带有C H O，是不是遵循帖子所说的线性关系？亲核亲电能不能用Hirshifeld来预测？我目前用的NPA

sobereva 发表于 Post on 2015-5-28 14:04:05

此文专门讨论这些问题
Phys.Chem.Chem.Phys.,2015, 17, 4977
你若要用shape function来定义稍微改下代码就行。

此问题我并不怎么关心

ORCA_in_TCC 发表于 Post on 2015-5-28 13:29:41

基于shape function得到的才是正在的Shannon entropy，因为都是归一化的，而基于电子密度的应该给另外一个名字，因为电子密度的积分是等于电子总数，所以文献中有些以讹传讹的概念。

ORCA_in_TCC 发表于 Post on 2015-5-28 13:22:45

本帖最后由 ORCA_in_TCC 于 2015-5-28 13:27 编辑

这就是“N-derivative of Shannon entropy of shape function for atoms” Chem. Physi. Lett. 410 (2005) 70–76一文。从这篇文章中的表2给出的数据可以发现，Ne之后的基于电子密度的Shannon entropy都是负值，而表1中的基于Shape function的Shannon entropy都是正值。

QQ截图20150528131829.jpg (70.71 KB, 下载次数 Times of downloads: 157)

ORCA_in_TCC 发表于 Post on 2015-5-28 13:12:16

但是这样计算出来的原子Shannon entropy对于原子序数大于10的原子会导致负熵的出现，这应该怎么去理解？

sobereva 发表于 Post on 2015-5-27 23:06:32

ORCA_in_TCC 发表于 2015-5-27 15:58
sob老师，multiwfn里面Shannon entropy是基于电子密度还是shape function(电子密度除以电子总数)？

电子密度。

手册2.6节有公式（编号50）

ORCA_in_TCC 发表于 Post on 2015-5-27 15:58:16

sob老师，multiwfn里面Shannon entropy是基于电子密度还是shape function(电子密度除以电子总数)？

sobereva 发表于 Post on 2015-5-26 22:32:32

tjuchan 发表于 2015-5-26 16:08
看来《Information Conservation Principle Determines Electrophilicity,Nucleophilicity, and Regiosel ...

文中只是全部计算时用scrf模型表现这种溶剂。
这种低极性溶剂对反应位点判断是不会有什么影响的，定量数值也不会有多少改变，没有可讨论的。

tjuchan 发表于 Post on 2015-5-26 16:08:17

sobereva 发表于 2015-5-18 21:53
怎么考虑得看情况。
隐式溶剂模型只能表现一个平均场。如果加了碱会导致反应发生了显著变化，那就应该 ...

看来《Information Conservation Principle Determines Electrophilicity,Nucleophilicity, and Regioselectivity》这篇文章，文中提及的采用CH2CL2作为溶剂，但是好像没有看见相关内容呢？

jlx_ 发表于 Post on 2015-5-19 09:15:31

sobereva 发表于 2015-5-18 21:53
怎么考虑得看情况。
隐式溶剂模型只能表现一个平均场。如果加了碱会导致反应发生了显著变化，那就应该 ...

谢谢

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register