本帖最后由 a617788816 于 2020-2-1 19:22 编辑 snljty 发表于 2020-2-1 17:32 谢谢， 已解决 |
a617788816 发表于 2020-2-1 17:18 Linux下用斜线'/'做分隔符，不是Windows/DOS下的反斜线'\'。 |
| 格式问题难倒一些人！ |
a617788816 发表于 2020-1-24 20:25 一看提示就知道末尾缺俩空行 应当在模板文件的[geometry]末尾增加至少两个空行 |
| 参与人数Participants 1 | eV +2 | 收起 理由Reason |
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| + 2 | 赞！ |
本帖最后由 a617788816 于 2020-1-24 21:42 编辑 liuyuje714 发表于 2020-1-24 21:33 谢谢 |
本帖最后由 liuyuje714 于 2020-1-24 21:36 编辑 a617788816 发表于 2020-1-24 21:30 。不好意思，看错了 |
liuyuje714 发表于 2020-1-24 21:21 请问是什么格式问题，能否详细解答，那是报错文件出来的格式，我想请问的是，我哪个文件的格式需要修改 |
| 格式有问题？你空行都不要了？ |
本帖最后由 a617788816 于 2020-1-24 21:34 编辑 sobereva 发表于 2020-1-24 18:22 sob老师在用它的原模板的情况下B3LYP/6-31G* em=GD3BJ opt, 程序是可运行的，虽然不收敛，我可以解决 但当我改它的关键词时，不管怎么样都运行不了，这是我一直要解决的问题，用的分子式您压缩包里的四水团簇分子 曾试过以下集中命令，均报错如下 pm6 opt pm6 em=GD3 opt M062X/6-31G* opt This Gaussian task did not perform geometry optimization at all!! Please check if you omitted "opt" keyword or there is any problem in the templete file 生成的gif文件应该没问题 %chk=gau.chk # pm6 em=GD3 opt Template file 0 1 O 22.22528695 21.88012343 22.13940668 H 21.93336414 22.10899604 21.26348342 H 21.81182736 22.55696239 22.76440037 O 24.73484283 22.32743230 22.65145089 H 25.09026877 21.54962411 23.06816983 H 23.81761813 22.07566547 22.31242172 O 24.06328868 24.26089128 24.25486339 H 24.42076840 25.06968075 23.90420824 H 24.47187320 23.51084458 23.71617677 O 21.55358956 23.81503608 23.74118150 H 22.47544686 24.14182772 23.99224010 H 21.13125722 23.55222087 24.55205084 Out文件的报错如下 Symbolic Z-matrix: Charge = 0 Multiplicity = 1 O 22.22529 21.88012 22.13941 H 21.93336 22.109 21.26348 H 21.81183 22.55696 22.7644 O 24.73484 22.32743 22.65145 H 25.09027 21.54962 23.06817 H 23.81762 22.07567 22.31242 O 24.06329 24.26089 24.25486 H 24.42077 25.06968 23.90421 H 24.47187 23.51084 23.71618 O 21.55359 23.81504 23.74118 H 22.47545 24.14183 23.99224 H 21.13126 23.55222 24.55205 End of file in ZSymb. Error termination via Lnk1e in E:\A\G09w\l101.exe at Fri Jan 24 20:55:08 2020. Job cpu time: 0 days 0 hours 0 minutes 0.0 seconds. File lengths (MBytes): RWF= 5 Int= 0 D2E= 0 Chk= 1 Scr= 1 |
a617788816 发表于 2020-1-24 17:49 M06-2X拟合参数的时候已经表现了中程相关，用BJ阻尼的D3校正本来就不合理，也没有拟合的参数。M06-2X系列等泛函应该用0阻尼的色散校正D3(0)，Gaussian写作EmpiricalDispersion=GD3。跑molclus之前如果对你用的关键词不熟悉，建议先用一个简单任务，直接用Gaussian试一下。 |
a617788816 发表于 2020-1-24 17:58 新图直接发在回帖里，不要贴到前头去 自行看备份出的.out，判断为什么报错，是关键词有问题还是几何优化不收敛之类，都是基于Gaussian常识自行判断。自己判断不出来就把文件压缩后上传 |
本帖最后由 a617788816 于 2020-1-24 18:05 编辑 sobereva 发表于 2020-1-24 17:52 我整个文件里，只写两个关键词 opt PM6D3 仍然无法运行，报错我的tem文件有问题，使用M062X也不可以运行，但他里面本身的模板可以运行，搞不明白，并且以它本身的模板运行，运行一下就开始报错，原因未知，报错如图F |
a617788816 发表于 2020-1-24 17:49 PM6D3已经带了D3，哪能还写empiricaldispersion=GD3BJ。这属于Gaussian基本使用常识问题，仔细看 DFT-D色散校正的使用 http://sobereva.com/210 |
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