sobereva 发表于 2020-4-1 02:45
使用molclus结合量子化学程序对二聚体构型做构型搜索，找出能量最低构型，仔细看以下文章

使用molclus程 ...

好的，谢谢sob老师，感谢您的提示，我这就去试试之后再有问题还要麻烦您了

使用molclus结合量子化学程序对二聚体构型做构型搜索，找出能量最低构型，仔细看以下文章

使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-577-1-1.html
genmer：生成团簇初始构型结合molclus做团簇结构搜索的超便捷工具
http://bbs.keinsci.com/thread-2369-1-1.html

搜索出能量最低构型后，在gview之类程序里量一下就知道距离。

作用能的计算看诸如
谈谈BSSE校正与Gaussian对它的处理
http://sobereva.com/46
在ORCA中做counterpoise校正并计算分子间结合能的例子
http://sobereva.com/542（http://bbs.keinsci.com/thread-16585-1-1.html）

也可以用Multiwfn程序通过AIM理论对氢键键能进行估计，仔细看（即便不用AIM，也非常建议看此文）
透彻认识氢键本质、简单可靠地估计氢键强度：一篇2019年JCC上的重要研究文章介绍
http://sobereva.com/513（http://bbs.keinsci.com/thread-14600-1-1.html）

我还写过很多和弱相互作用有关的文章，看下文末尾我给出的列表
谈谈学量子化学如何正确地入门
http://sobereva.com/355（http://bbs.keinsci.com/thread-4447-1-1.html）