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直接拿出两个相邻的坐标算就完了。重原子位置是否优化取决于是否想让结果对应晶体结构的情况, 氢原子位置则必须优化。 是否需要考虑更周围的原子的效果取决于你具体想算什么问题。要考虑的话参考 帮助设定Gaussian输入文件中优化flag和MM电荷的小工具 http://sobereva.com/332(http://bbs.keinsci.com/thread-3464-1-1.html) |
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