jennine 发表于 2020-12-31 13:53 Linux基本常识问题，随便一google便知，就是把我博文里的export开头的命令敲进终端 |
| 你好 环境变量怎么设置啊 |
Daniel_Arndt 发表于 2020-5-31 01:12 感谢分享，有些不一样，我理解理解好啦 |
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你可能需要查看这个网址上的“Update 3”部分： https://superuser.com/questions/ ... h-bsub-platform-lsf 。 我记得LSF可以在bsub里面添上“sh job.sh”的。我几年前弄过一次。就是，你把所需要设置的环境变量和“g09 input.com”写到一个job.sh（我随便写的一个文件名，当然你得按照bash的语法来，文件的第一行得是“#!/bin/bash”）里面，然后把你通常用的bsub命令里面“g09 input.com”这一部分换成“sh job.sh”，然后就可以运行了。 |
sobereva 发表于 2020-5-30 15:04 太感谢sob老师了，设定了系统的环境变量，能正常运行了。（用命令方式运行Gaussian确实没生效） |
吴磊 发表于 2020-5-30 14:50 我不知道你怎么运行的。以这种方式设置必须得通过命令行方式运行Gaussian（但也未必能生效），要么在“系统”里定义环境变量。 |
sobereva 发表于 2020-5-30 14:06 感谢sob老师的回复，但我直接在cmd命令中输入如下信息没能解决“Unable to choose the S8 parameter”的问题，是我理解不对还是缺少了啥操作。（这是TPSSh的D3BJ参数） set GAUSS_DFTD3_S6=1000000 set GAUSS_DFTD3_S8=2238200 set GAUSS_DFTD3_ABJ1=452900 set GAUSS_DFTD3_ABJ2=4655000 |
吴磊 发表于 2020-5-30 13:11 Windows同样可以设置环境变量，在cmd下用set命令，诸如set x=3 |
本帖最后由 hebrewsnabla 于 2020-5-30 13:34 编辑 吴磊 发表于 2020-5-30 13:11 如果是DSD-PBEP86的话，G16不用设置，直接用。 |
hebrewsnabla 发表于 2020-5-30 12:19 您好，我自己电脑上安装的是windows版的Gaussian09，看到sob老师博文http://sobereva.com/210里说linux系统在工作台中输入export GAUSS_DFTD3_S6=1000000 export GAUSS_DFTD3_S8=786200 export GAUSS_DFTD3_ABJ1=2097100 export GAUSS_DFTD3_ABJ2=7592300 不知道Windows系统下怎么设置。另外，我用的超算中心是上海的HPCPLUS,是Linux系统下的Gaussian16，用".lsf"文件提交作业，在".lsf"文件中输入上述的环境变量设置没起作用。 |
吴磊 发表于 2020-5-30 08:43 色散校正环境变量设置有什么问题要说出来，你说个“没能设置”“还没解决”等于没说 |
snljty 发表于 2020-5-30 08:37 谢谢，因为做benchmark所以想多试试，非内置方法的其他地方都看懂了，就是这个色散校正的到现在还没解决。 |
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看你指的具体是哪个泛函，比如DSD-PBEP86-D3(BJ)在Gaussian16中直接支持，Gaussian09中用法看这个贴的2.2节 《Gaussian中非内置的理论方法和泛函的用法》 http://bbs.keinsci.com/thread-3997-1-1.html |
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