萌萌坏坏 发表于 2020-8-14 14:38 自己不会写搞计算化学的人理应都会的shell脚本的编写还赖程序？ Shermo已经没法更友好了 明明Shermo都提供了命令行模式直接用 -E [能量] 参数指定能量值来便于自己写脚本调用，干嘛自己一个一个手动往settings.ini里复制？ 用shell脚本把提取的数据整理成csv格式，直接excel就能打开，Shermo的设计简直令大批体系热力学数据的计算简化到没法更容易。 shell编程，用我上面的链接，能力正常的人半天怎么也都学得差不多了。而且一劳永逸，让以后处理类似问题的时间节约一个数量级以上。 |
| 参与人数Participants 1 | eV +3 | 收起 理由Reason |
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| + 3 | 我很赞同 |
萌萌坏坏 发表于 2020-8-14 16:58 http://linux.vbird.org/linux_basic/0340bashshell-scripts.php |
thanhtam 发表于 2020-8-14 16:48 您好，请问您会写批处理的脚本吗？我需要把scf能量改好放到setting里面，然后把shermo里面的ΔG和配分函数的数据导出来到excel里面。可以大概教教我吗？麻烦您了！ |
萌萌坏坏 发表于 2020-8-14 16:39 这脚本估计不超过十行…… |
thanhtam 发表于 2020-8-14 16:35 我看到老师说“可以通过双击图标执行，也可以通过纯命令行方式运行，因此可以非常容易地嵌入到批处理脚本中，从而一次性计算一大批体系”。 对没学过编程的人来说  ，我太难了，等我学完脚本编程批处理程序，我估计也就差不多算完了 |
萌萌坏坏 发表于 2020-8-14 14:38 linux版本支持简单一点的调用方式。 算几百个当然得写批处理程序了 |
萌萌坏坏 发表于 2020-8-14 14:38 算好几百个反应就厉害了。。。。。我算一个反应算了好几百个结构。。。。好几百个反应不敢想  |
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好的谢谢老师！！ 小小吐槽一下，我用过shermo,这个程序使用起来对于我这样要算好几百个反应的人来说，实在太容易出错了，因为要把每个反应物和产物的SCF还有温度粘到settings里面-----保存好---关闭----再打开shermo。只能改一个物质的温度，直接改整个反应过程的温度还要一个一个保存实在是。。。。。。。不如我直接取Gauss的结果。。这个程序真的很友好，但是。。。。我还是用Excel吧。 |
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看看是否频率校正因子有区别，以及kisthelp解析出来的振动频率是否和输出文件里的一致 最好的做法是通过Shermo来算配分函数或者自由能。把Shermo算出来的自由能直接代入到我的excel表格里直接就出来反应速率常数了 使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据 http://sobereva.com/552（http://bbs.keinsci.com/thread-17494-1-1.html） 有了灵活强大的Shermo，Gaussian直接输出的热力学信息可以完全弃了。输出的所有信息，以及计算原理，在Shermo手册里都有特别详细的解释。 |
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