关于大环分子中两个二面角同时进行柔性扫描问题

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发布时间: 2020-11-11 21:09

如图所示分子，我想同时让C4-C9和C11-12两个单键旋转（即呋喃环旋转360度），请问各位老师用柔性扫描如何实现？我试了扫描C5-C4-C9-C10二面角但是总是失败，我写的算法如下，请问该如何修改？还有我末尾写的限制性 ...

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大肥猫 发表于 Post on 2020-11-15 16:13:09

sobereva 发表于 2020-11-15 08:24
好好把我的博文里的GIC介绍看了，举一反三

好的老师，我在尝试了，有问题再请教您！

sobereva 发表于 Post on 2020-11-15 08:24:09

大肥猫发表于 2020-11-14 15:26
您好，您给的例子是非环状手性中心的翻转例子，请问我要实现这个环中呋喃环的旋转如何写扫描语言呢？

好好把我的博文里的GIC介绍看了，举一反三

大肥猫 发表于 Post on 2020-11-14 15:26:49

喵星大佬发表于 2020-11-12 21:37
https://mp.weixin.qq.com/s/bs-oJ6EDnFh6y1KDKqwD7A

您好，您给的例子是非环状手性中心的翻转例子，请问我要实现这个环中呋喃环的旋转如何写扫描语言呢？

大肥猫 发表于 Post on 2020-11-13 10:38:43

喵星大佬发表于 2020-11-12 21:37
https://mp.weixin.qq.com/s/bs-oJ6EDnFh6y1KDKqwD7A

谢谢您~我尝试一下，不懂的地方再来请教

大肥猫 发表于 Post on 2020-11-13 10:36:44

123qwertybobo 发表于 2020-11-12 21:09
9 10 都F了，你咋旋转呢？

“9 10 F” 的意思不是固定C9-C10键长的意思吗？

喵星大佬 发表于 Post on 2020-11-12 21:37:12

https://mp.weixin.qq.com/s/bs-oJ6EDnFh6y1KDKqwD7A

123qwertybobo 发表于 Post on 2020-11-12 21:09:54

9 10 都F了，你咋旋转呢？

sobereva 发表于 Post on 2020-11-11 21:14:56

尝试用GIC定义扫描设定，让两个二面角同步旋转，仔细看
详谈使用Gaussian做势能面扫描
http://sobereva.com/474（http://bbs.keinsci.com/thread-12660-1-1.html）

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