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含Ge体系找过渡态没有虚频求助

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发布时间: 2020-11-27 22:34

正文摘要:

143个原子,有机配体,配有一个主族金属Ge, 过渡态找了很久,这是现有最大的计算资源了。 %mem=30GB %nprocshared=12 #p opt=(calcfc,ts,noeigen,gdiis) freq b3lyp/6-31g(d,p) empiricaldispersion=gd3bj int ...

回复 Reply

huozhong 发表于 Post on 2020-11-30 23:54:52
sobereva 发表于 2020-11-30 10:13
对这种体系pm6、pm7可靠性极低,也就对常见的主族元素可靠性还稍微高点
问lxxx这种报错毫无意义,仔细看 ...

好的,谢谢卢老师
sobereva 发表于 Post on 2020-11-30 10:13:40
huozhong 发表于 2020-11-28 11:13
最初从pm6 pm7开始尝试,总是报错Error termination request processed by link 9999.

对这种体系pm6、pm7可靠性极低,也就对常见的主族元素可靠性还稍微高点
问lxxx这种报错毫无意义,仔细看
量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法
http://sobereva.com/164
必须自己拿gview看优化轨迹,搞清楚到底发生了什么
wzkchem5 发表于 Post on 2020-11-28 15:46:36
huozhong 发表于 2020-11-28 14:33
由衷感谢您的指导,我是新手。请问从现在收敛的结构忘两边扫描怎么输命令,谢谢谢谢~~~

你现在的过渡态是怎么找的,往两边找过渡态用完全一样的办法就行
huozhong 发表于 Post on 2020-11-28 14:41:31
wzkchem5 发表于 2020-11-28 11:54
试试把你现在优化出来的结构当成一个中间体,分别往前和往后做扫描,看是否能得到两个过渡态。
没有任何 ...

是跑IRC吗
huozhong 发表于 Post on 2020-11-28 14:33:41
wzkchem5 发表于 2020-11-28 11:54
试试把你现在优化出来的结构当成一个中间体,分别往前和往后做扫描,看是否能得到两个过渡态。
没有任何 ...

由衷感谢您的指导,我是新手。请问从现在收敛的结构忘两边扫描怎么输命令,谢谢谢谢~~~
wzkchem5 发表于 Post on 2020-11-28 11:54:32
huozhong 发表于 2020-11-28 11:10
其实就是一个锗配合物的催化反应,第一步不知道是怎么反应的。因为吡啶与HBpin不反应,催化剂与吡啶不反 ...

试试把你现在优化出来的结构当成一个中间体,分别往前和往后做扫描,看是否能得到两个过渡态。
没有任何理由先入为主地相信Int-0到Int-1一定是一步反应。
huozhong 发表于 Post on 2020-11-28 11:13:35
sobereva 发表于 2020-11-28 07:55
以后标题里别带“急!”这种字,显得很浮躁,也破坏论坛气氛,给你去掉了,以后注意

显然首先考虑过渡态 ...

最初从pm6 pm7开始尝试,总是报错Error termination request processed by link 9999.
huozhong 发表于 Post on 2020-11-28 11:11:38
huozhong 发表于 2020-11-28 11:10
其实就是一个锗配合物的催化反应,第一步不知道是怎么反应的。因为吡啶与HBpin不反应,催化剂与吡啶不反 ...

ts2收敛了,虚频振动方向也对
huozhong 发表于 Post on 2020-11-28 11:10:38
sobereva 发表于 2020-11-28 07:55
以后标题里别带“急!”这种字,显得很浮躁,也破坏论坛气氛,给你去掉了,以后注意

显然首先考虑过渡态 ...

好的 社长,以后一定注意!
wzkchem5 发表于 Post on 2020-11-28 10:57:21
看不太出来你想算的过渡态是什么,不过是不是在Ge上的取代反应?
如果是的话,注意Ge的最大配位数可以到6,同样的反应在碳上面取代是过渡态,在Ge上面取代有可能是中间体。不要先入为主认为是过渡态,然后怪程序算错了,量化计算不是这么做的,如果先入为主的判断必须都对,还要量化计算干什么?
一开始认为是一个过渡态直接反应过去,结果发现有一个中间体,两边各有一个过渡态,这是很常见的现象。
sobereva 发表于 Post on 2020-11-28 07:55:55
以后标题里别带“急!”这种字,显得很浮躁,也破坏论坛气氛,给你去掉了,以后注意

显然首先考虑过渡态初猜不合适所致,尝试其它初猜结构

http://sobereva.com/164是讲怎么帮助几何优化收敛的,和你当前的问题毫无联系

如果缺乏过渡态搜索常识,看
简谈Gaussian里找过渡态的关键词opt=TS和QST2、3
http://sobereva.com/460http://bbs.keinsci.com/thread-12093-1-1.html

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