z1065480896 发表于 2022-2-10 16:50 CCDC的Mercury做的,前面说了 |
Novice 发表于 2021-1-19 15:04 想问下这个图使用什么软件做出来的 |
sobereva 发表于 2021-1-20 04:58 谢谢老师 |
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我写过现成的 计算两个平面夹角的小程序 http://sobereva.com/302(http://bbs.keinsci.com/thread-1623-1-1.html) |
| 嗯嗯,图形操作很方便,越做功能越丰富,好像新版必须要有序列号?我也没有下载最新版,不太清楚。 |
Novice 发表于 2021-1-19 15:04 原来真的可以这样做,我之前只在mercury里量过一个原子到一个平面的距离 |
Novice 发表于 2021-1-19 14:41 可以具体说说 什么模块能够做这种测量吗? |
| 参与人数Participants 1 | eV +1 | 收起 理由Reason |
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| + 1 | 见下帖 |
| 你可以导出成xyz或者sdf格式,然后在Mercury中测量一下,Mercury的有些常用功能是免费的。 |
| 合理做法是:分别确定两个环的最小二乘平面的法向矢量(用Multiwfn好像可以做),然后求这两个法矢的点积的反余弦就得交角。 |
paramecium86 发表于 2021-1-19 11:51 非常感谢 |
王二葛 发表于 2021-1-19 11:28 感谢回复 |
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GaussView没法测量不具有2个共同原子的两个环的夹角。通用的方法就如楼上所说用到空间解析几何的方法 1. 选取平面上三点得到平面方程 2. 根据平面方程可以求出两个平面二面角 自己如果觉得算着麻烦,这里补充一下两个在线的计算器。可以借助下面两个在线的计算器得到夹角。 https://keisan.casio.com/exec/system/1223596129 输入三点坐标得到平面方程的 在线计算器 https://onlinemschool.com/math/a ... rdinate/plane_angl/ 根据两个平面方程求二面角的在线工具 |
| 参与人数Participants 1 | eV +5 | 收起 理由Reason |
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| + 5 | 谢谢分享 |
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既然无法用 GaussView 直接量角,那直接计算也不复杂。 计算方法是,1. 在这两个苯环上各选三个点,计算出两个法向量,2. 求这两个法向量的夹角。(因为法向量的方向跟选取的三个点有关,所以二面角也可能是法向量夹角的补角。) |
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