wzkchem5 发表于 2021-3-16 21:45 好的，谢谢老师的耐心解答！ |
yang2020 发表于 2021-3-16 18:40 如果只是略微大于0，那就是吸附很困难但是能吸附一点。假设你已经做了1.89kcal/mol的标准态校正了的话，结合自由能略微大于0，意味着当你要吸附的物质的浓度达到1mol/L时，吸附的量略小于饱和吸附量的一半。如果你关心的就是这种浓溶液的吸附，那就算可以吸附；如果你是想设计在很稀的溶液（比如1mmol/L以下）里仍然有显著吸附的材料，那就算不能吸附。 |
wzkchem5 发表于 2021-1-31 17:09 老师您好，请问一下我在SMD隐性溶剂模型下算的结合Gibbs自由能（复合物Gibbs自由能-两个单体Gibbs自由能的和）在0附近，略微大于0。但是算的结合能却明显是比较负的负值。那这种的情况下，能说明会发生吸附吗？ |
yang2020 发表于 2021-1-31 13:22 1 这种氢键是弱相互作用范畴，都不算化学键，显然不算化学吸附 2 实际一算便知，估计都跑了 3 可能会收敛到原先形成N-H氢键的结构，也可能收敛到形成pi-氢键的结构 |
yang2020 发表于 2021-1-31 21:45 没有，这些都是常识。研究吸附作用应该先证明能吸附，再去研究，否则研究出来的都是真空中的球形鸡。 |
wzkchem5 发表于 2021-1-31 17:09 好的，谢谢。请问有相关计算资料吗  |
| 建议算一下结合Gibbs自由能，如果结合Gibbs自由能明显大于0，说明不能吸附，你现在算的都白算 |
sobereva 发表于 2021-1-31 12:55 十分感谢老师的回复 1 对于我这个体系我理解的是：未掺杂N时，因为被吸附的物质是带电的离子，骨架吸附磷酸一氢根只是单纯的静电吸引作用，属于物理吸附，并没有发生化学反应，所以结合能特别小。而掺杂了吡啶氮后，吡啶氮有孤对电子，且磷酸一氢根有氢，会与N有氢键作用，那这是属于化学吸附吗? 2 假如我把离子换成磷酸根，没有了氢，掺N骨架对其吸附是怎么样的呢？ 3. 如果优化前将磷酸一氢根放在碳骨架平面上方而不是边缘位置时，优化后掺杂的N也会与磷酸一氢根形成氢键吗 |
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1 从骨架的表面静电势直接就能反映出来，肯定氮掺杂之后在氮的位置表面静电势变得很负，因此是很强的氢键受体。看 静电势与平均局部离子化能相关资料合集 http://bbs.keinsci.com/thread-219-1-1.html 2 磷酸一氢根上面有氢啊，明显可以和N有氢键作用 3 要画就话sign(lambda2)rho着色的等值面图，别光画个等值面图 4 这种典型的氢键显然是静电作用主导，仔细看 透彻认识氢键本质、简单可靠地估计氢键强度：一篇2019年JCC上的重要研究文章介绍 http://sobereva.com/513（http://bbs.keinsci.com/thread-14600-1-1.html） 色散作用本来就属于范德华作用的一部分，仔细看此文相关部分了解基本关系 谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正？” http://sobereva.com/413（http://bbs.keinsci.com/thread-9772-1-1.html） 5 合理 以后发图的时候把图弄好了再发 不要让图片有很大面积的白边，并且把图片尺寸修改好了再传，别直接把Multiwfn输出的较大像素的图直接贴。更不要把图片尺寸弄过小，而且还比例失调。你贴的一大堆尺寸大大小小凌乱的图看着很难受。 |
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图有点多，老师勿怪 |
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