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求助有机化学反应势垒和反应热计算步骤

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发布时间: 2021-3-7 13:22

正文摘要:

请高手简述一下采用Gaussian以及Gaussview计算有机反应势垒和反应热的步骤,拿图中反应举一个例子,分享一下有关教程更好,谢谢啦

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wzkchem5 发表于 Post on 2021-3-9 21:20:31
kgf2021 发表于 2021-3-9 20:08
大神,乙炔环化成苯的优化不好搞啊,乙炔是三个原子共线,用高斯算会出错,而且反应需要催化剂,求解答

如果反应需要催化剂,那么只有知道催化剂的结构(指的是三维结构,不是分子式,如果是异相催化剂还需要知道是用哪个晶面催化的),以及催化剂催化这个反应涉及的所有中间体,才能计算。如果直接把3个乙炔摆在一起算,得到的是不存在催化剂的条件下的势垒,会高得离谱,而且也不能和实验的催化反应比较。
kgf2021 发表于 Post on 2021-3-9 20:08:22
wzkchem5 发表于 2021-3-8 16:09
不会搜也就算了,点链接再点链接的链接都不会吗?
http://sobereva.com/552里提到“笔者之前还写过《She ...

大神,乙炔环化成苯的优化不好搞啊,乙炔是三个原子共线,用高斯算会出错,而且反应需要催化剂,求解答
kgf2021 发表于 Post on 2021-3-9 20:06:27

大神,乙炔环化成苯的优化不好搞啊,乙炔是三个原子共线,用高斯算会出错,而且反应需要催化剂,求解答
kgf2021 发表于 Post on 2021-3-9 13:54:39
wzkchem5 发表于 2021-3-8 16:09
不会搜也就算了,点链接再点链接的链接都不会吗?
http://sobereva.com/552里提到“笔者之前还写过《She ...

多谢提醒
sobereva 发表于 Post on 2021-3-9 04:22:18
kgf2021 发表于 2021-3-8 15:35
看来是我不会搜关键词,这个Shermo软件在哪可以免费下载

在网上求助计算化学问题时的注意事项
http://sobereva.com/79http://bbs.keinsci.com/thread-57-1-1.html
wzkchem5 发表于 Post on 2021-3-8 16:09:20
kgf2021 发表于 2021-3-8 15:35
看来是我不会搜关键词,这个Shermo软件在哪可以免费下载

不会搜也就算了,点链接再点链接的链接都不会吗?
http://sobereva.com/552里提到“笔者之前还写过《Shermo:计算气相分子配分函数和热力学数据的简单程序》(http://sobereva.com/315)一文”,点开http://sobereva.com/315就看到了啊
kgf2021 发表于 Post on 2021-3-8 15:35:16
本帖最后由 kgf2021 于 2021-3-8 15:40 编辑
sobereva 发表于 2021-3-7 23:49
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,避免 ...

看来是我不会搜关键词,这个Shermo软件在哪可以免费下载
sobereva 发表于 Post on 2021-3-7 23:49:10
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,避免有任何歧义,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题“ 有机化学 反应势垒和反应热”改了,以后务必注意,下次将扣分处理

好好把此文看了
谈谈学量子化学如何正确地入门
http://sobereva.com/355http://bbs.keinsci.com/thread-4447-1-1.html

热化学数据怎么得到这里写明了
使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据
http://sobereva.com/552http://bbs.keinsci.com/thread-17494-1-1.html

这类司空见惯的问题,用论坛首页google框搜不到相关信息才怪
wzkchem5 发表于 Post on 2021-3-7 22:24:44
kgf2021 发表于 2021-3-7 21:45
我用柔性扫描找到了那个反应的过渡态,算出来的势垒为137.55,为什么反应热和势垒都和图里的有误差

贴一下文献的计算方法部分以及你的输入文件
wzkchem5 发表于 Post on 2021-3-7 22:22:52
kgf2021 发表于 2021-3-7 21:19
# PM7 opt=modredundant nosymm                  这里nosymm代表啥   

opt里calcfc和calcall的区别

http://gaussian.com/keywords/
kgf2021 发表于 Post on 2021-3-7 21:45:30
本帖最后由 kgf2021 于 2021-3-7 22:21 编辑

我用柔性扫描找到了那个反应的过渡态,算出来的势垒为137.55,为什么反应热和势垒都和图里的有误差
kgf2021 发表于 Post on 2021-3-7 21:19:35
本帖最后由 kgf2021 于 2021-3-7 21:34 编辑
wzkchem5 发表于 2021-3-7 19:29
http://sobereva.com/460
看完如果有不懂的,摘引原句针对性提问

# PM7 opt=modredundant nosymm                  这里nosymm代表啥   

opt里calcfc和calcall的区别
ms860309 发表于 Post on 2021-3-7 20:12:40
kgf2021 发表于 2021-3-7 20:01
乙烷消氢生成乙炔反应是吸热反应,过渡态结构更偏向乙烯,用TS算的话,初猜结构我还是不知道怎么猜

如果需要TS的initial guess
可以參考
http://sobereva.com/44

我個人比較有經驗是string method

不過TS成功率通常都不太高 需要多嘗試
kgf2021 发表于 Post on 2021-3-7 20:01:48
wzkchem5 发表于 2021-3-7 19:29
见http://sobereva.com/460
看完如果有不懂的,摘引原句针对性提问

乙烷消氢生成乙炔反应是吸热反应,过渡态结构更偏向乙烯,用TS算的话,初猜结构我还是不知道怎么猜

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