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吐槽，又见顶刊瞎算乱算

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fwz3888

发布时间: 2021-5-21 20:07

正文摘要:

本帖最后由 fwz3888 于 2021-5-21 20:43 编辑虽说JACS、ANGEW等化学顶刊上缺乏计算化学常识的行为屡见不鲜，但SCIENCE上这么离谱的计算还是头一次看到。本文计算部分研究了一系列氯自由基与不同σ-don ...

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fwz3888 发表于 Post on 2021-6-2 16:42:09

喵星大佬发表于 2021-6-2 04:28
这么小的体系没必要DLPNO吧。。。。这才几个原子。再就是开壳层体系可能有一定静态相关的情况下CCSD(T)未 ...

单纯图个快，我就图一乐算着玩玩。亲核试剂对自由基有稳定化作用并不奇怪，但是文中一些结论还是有疑点。
话说真要研究这个，准就直接上MDCISD+Q了

喵星大佬 发表于 Post on 2021-6-2 04:28:28

fwz3888 发表于 2021-5-21 22:09
我正尝试用DLPNO-CCSD(T)/CBS验证文中的结论。
我的一些实验工作与这里的结论有一些关系，试图用比 ...

这么小的体系没必要DLPNO吧。。。。这才几个原子。再就是开壳层体系可能有一定静态相关的情况下CCSD(T)未必好使，感觉还是应该上多参考。

sobereva 发表于 Post on 2021-6-1 15:10:17

朽木可自雕发表于 2021-5-22 21:08
QC有啥毛病？？求解
这个是官网上的scf=qc的解释：
Calls for the use of a quadratically convergent SC ...

仔细看相关部分
解决SCF不收敛问题的方法
http://sobereva.com/61

化学ren 发表于 Post on 2021-6-1 10:58:24

强烈关注Zuo下篇文章如何写机理

wzkchem5 发表于 Post on 2021-5-24 17:17:13

hdhxx123 发表于 2021-5-22 14:22
scf=qc是在用牛顿法收敛到极小值但是并不一定是全局极小值

牛顿法其实连极小值点都不能保证，可能收敛到鞍点乃至高阶鞍点

fwz3888 发表于 Post on 2021-5-24 16:47:49

文艺青年别装笔发表于 2021-5-24 14:47
请问，这篇文章的问题是不是可以理解成，由于体系比较小，所以应该用更精细更合适的基组进行计算，使用b3ly ...

B3LYP描述弱相互作用，尤其是色散为主的，非常失败。
详见Sob老师关于DFT-D的博文

wang7344412 发表于 Post on 2021-5-24 16:11:24

朽木可自雕发表于 2021-5-22 21:04
不知道一些人是从哪里学来的坏毛病，在Gaussian里老是想用CPCM、贴出来的关键词里带着CPCM，笔者每当看见这 ...

http://sobereva.com/327 谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/331 常见的多余的和被滥用的Gaussian关键词

文艺青年别装笔 发表于 Post on 2021-5-24 14:47:48

请问，这篇文章的问题是不是可以理解成，由于体系比较小，所以应该用更精细更合适的基组进行计算，使用b3lyp太粗糙了。

wzkchem5 发表于 Post on 2021-5-22 23:04:35

朽木可自雕发表于 2021-5-22 14:08
QC有啥毛病？？求解
这个是官网上的scf=qc的解释：
Calls for the use of a quadratically convergent SC ...

这里的reliable指的是收敛概率高，不是收敛到最低能量解的概率高

hdhxx123 发表于 Post on 2021-5-22 21:22:58

朽木可自雕发表于 2021-5-22 21:08
QC有啥毛病？？求解
这个是官网上的scf=qc的解释：
Calls for the use of a quadratically convergent SC ...

scf=qc是在用牛顿法收敛到极小值但是并不一定是全局极小值

hdhxx123 发表于 Post on 2021-5-22 21:15:34

朽木可自雕发表于 2021-5-22 21:08
QC有啥毛病？？求解
这个是官网上的scf=qc的解释：
Calls for the use of a quadratically convergent SC ...

论坛里搜搜就知道了,scf=qc易收敛到波函数不稳定的解

朽木可自雕 发表于 Post on 2021-5-22 21:08:37

QC有啥毛病？？求解
这个是官网上的scf=qc的解释：
Calls for the use of a quadratically convergent SCF procedure [Bacskay81]. By default this involves linear searches when far from convergence and Newton-Raphson steps when close (unless the energy goes up). This method is slower than regular SCF with DIIS extrapolation but is more reliable. SCF=QC is not available for restricted open shell (RO) calculations.
可以得到更值得信任的结果啊。所以为啥scf=qc被吐槽？

朽木可自雕 发表于 Post on 2021-5-22 21:04:49

不知道一些人是从哪里学来的坏毛病，在Gaussian里老是想用CPCM、贴出来的关键词里带着CPCM，笔者每当看见这种情况就很不爽。CPCM本身是PCM的近似，而IEFPCM又是PCM的最佳实现形式。显然放着Gaussian里是默认的而且是更好的IEFPCM不用，而刻意去用CPCM，完全就是自取其辱！！！另外，CPCM在Gaussian里对于中性体系用的参数是错的，这点在J. Chem. Theory Comput., 11, 4220 (2015)里专门提到了，结果一定程度上不可靠。所以绝对不要在Gaussian里用CPCM！！！

摘自：http://sobereva.com/331 谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算

smooth85 发表于 Post on 2021-5-22 16:18:30

实验团队“起义”搞计算的不少

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