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[综合交流] 吐槽,又见顶刊瞎算乱算

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本帖最后由 fwz3888 于 2021-5-21 20:43 编辑








虽说JACS、ANGEW等化学顶刊上缺乏计算化学常识的行为屡见不鲜,但SCIENCE上这么离谱的计算还是头一次看到。
本文计算部分研究了一系列氯自由基与不同σ-donor间的相互作用,且不说SCF=QC、CPCM等,研究此等弱相互作用不用BSSE也罢,连D3都没有?



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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-21 20:16:12 | 只看该作者 Only view this author
上传正文供大家阅读讨论,计算细节在SI中。
于我个人而言,文章前面的动力学及对比实验部分确实令我信服,但关于前人可以捕获到RO·的解释,尤其是SI中的复合物优化及相互作用能研究部分实在勉强。

847.full-1.pdf (948.75 KB, 下载次数 Times of downloads: 221)


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发表于 Post on 2021-5-21 21:32:38 来自手机 | 只看该作者 Only view this author
Chloride atoms是什么鬼

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发表于 Post on 2021-5-21 21:34:53 | 只看该作者 Only view this author
这么小的体系就应该直接上MRCISD+Q,TZ/QZ外推至基组极限。。。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2021-5-21 22:02:41 | 只看该作者 Only view this author
不错,这回又多了个教育初学者不要迷信顶刊的极好的反面教材
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 2021-5-21 22:03:32 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-5-21 21:34
这么小的体系就应该直接上MRCISD+Q,TZ/QZ外推至基组极限。。。

一下避免了BSSE问题,妙啊

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-21 22:09:38 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-5-21 21:34
这么小的体系就应该直接上MRCISD+Q,TZ/QZ外推至基组极限。。。

我正尝试用DLPNO-CCSD(T)/CBS验证文中的结论。
我的一些实验工作与这里的结论有一些关系,试图用比较少的时间来验证一下文中的结论是否定性正确。

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发表于 Post on 2021-5-21 22:14:31 | 只看该作者 Only view this author
fwz3888 发表于 2021-5-21 22:09
我正尝试用DLPNO-CCSD(T)/CBS验证文中的结论。
我的一些实验工作与这里的结论有一些关系,试图用比 ...

233333埋伏一波comment
真·探

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-21 22:19:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-5-21 22:02
不错,这回又多了个教育初学者不要迷信顶刊的极好的反面教材

话说根据身边人的投稿经历,N/S这种期刊只要正文里有计算化学部分,必定有专业的从事量化计算的审稿人。这回这个情况多半是因为计算全在SI里导致的疏忽。当然迷信顶刊绝对不可取,尤其JACS/ANGEW上的计算有时简直群魔乱舞。
不过话说回来,本来感觉这是蛮不错的机理研究,看到这个计算好感全无,甚至对其结论是否正确产生疑问。

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发表于 Post on 2021-5-21 22:30:28 | 只看该作者 Only view this author
fwz3888 发表于 2021-5-21 22:19
话说根据身边人的投稿经历,N/S这种期刊只要正文里有计算化学部分,必定有专业的从事量化计算的审稿人。 ...

既然有搞计算的审稿人,就理应盯紧了计算部分,哪怕是在SI里。不能不令人质疑一次Science选审稿人的水平
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-21 22:37:00 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-5-21 22:30
既然有搞计算的审稿人,就理应盯紧了计算部分,哪怕是在SI里。不能不令人质疑一次Science选审稿人的水平

确实,无论如何这种业余的错误都是不应该在Science这种期刊上出现的。
或者说不应该在任何一个专业的学术期刊上出现。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-21 22:56:13 | 只看该作者 Only view this author
hdhxx123 发表于 2021-5-21 22:14
233333埋伏一波comment

哈哈哈我等也只敢在论坛里吐槽一下
不过我倒是很期待文中直接被diss的那位的comment,看热闹是其次,希望能够增进对这个体系的认识。毕竟这篇中还有一些没有解释清楚的问题

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发表于 Post on 2021-5-21 23:05:34 | 只看该作者 Only view this author
fwz3888 发表于 2021-5-21 22:19
话说根据身边人的投稿经历,N/S这种期刊只要正文里有计算化学部分,必定有专业的从事量化计算的审稿人。 ...

“群魔乱舞” 评论到位!

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发表于 Post on 2021-5-22 10:23:47 | 只看该作者 Only view this author
用SCF=QC这个有什么问题吗?假如他波函数不收敛,虽然QC可能收敛到不是稳定的波函数。

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发表于 Post on 2021-5-22 10:44:21 | 只看该作者 Only view this author
体系这么小 用B3LYP/6-311++G(d,p)不太准确吧,确实没色散校正,也没说加了BSSE,估计审稿人都是做实验的罢了

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