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分析球状液滴粒子数/密度的脚本

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jimulation

发布时间: 2021-6-8 11:51

正文摘要:

本帖最后由 jimulation 于 2021-6-9 10:38 编辑初学VMD脚本编写，于是选了个简单体系（真空中的水滴）来模拟和分析。看到公社里有讨论过类似问题，思路是以盒子中心为参考点，计算落在不同半径球壳 ...

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961106 发表于 Post on 2022-6-9 18:29:37

老师您好我也是模拟气相中的液滴，想分析粒子数、密度，发现液滴会偏离盒子中心，所以用了您的脚本，我的盒子是999.99nm的正方体，我想计算0-500ps从液滴中心处到周边8nm的密度，于是用您的脚本修改了一下一些参数提交了，但是生成的结果只有横坐标，请问这是为什么呢，是我有些参数没调对吗，谢谢老师！还有老师我看sob老师的脚本里还需要输入盒子的中心，您的脚本里不需要吗？谢谢

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