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使用Multiwfn计算晶体结构中自由区域的体积、图形化展现自由区域

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发布时间: 2021-9-15 05:18

正文摘要:

使用Multiwfn计算晶体结构中自由区域的体积、图形化展现自由区域Using Multiwfn to calculate volume of free regions in crystal structures and graphically display free regions 文/Sobereva@北京科音 & ...

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annaqz 发表于 Post on 2024-7-5 15:50:22
aw6we6 发表于 2024-7-4 17:09
hello,我最近也在做这个,我想请教一下,MS使用Connolly surface得到的结果和Multiwfn得到的free volume ...

这个我还真没比较过,你可以算一下对比看看
aw6we6 发表于 Post on 2024-7-4 17:09:35
annaqz 发表于 2021-11-4 17:31
社长,请问一下,Multiwfn能否实现孔径分布曲线(PSD)的绘制呢?而且为什么同样cif文件,MS使用Connolly s ...

hello,我最近也在做这个,我想请教一下,MS使用Connolly surface得到的结果和Multiwfn得到的free volume,这两者哪个更大一些呢?PS:不知道是否还记的相差大概有多少?
annaqz 发表于 Post on 2022-7-20 13:08:25
iniway 发表于 2022-7-19 16:34
Poreblazer 3.0.2 Lev Sarkisov
http://www.homepages.ed.ac.uk/lsarkiso/Research.html
Poreblazer is ...

收到。感谢回复!
iniway 发表于 Post on 2022-7-19 16:34:32
annaqz 发表于 2022-5-23 10:25
哦哦,原来如此。感谢回复!除了zeo++,还有什么软件呢?

Poreblazer 3.0.2 Lev Sarkisov
http://www.homepages.ed.ac.uk/lsarkiso/Research.html
Poreblazer is a set of Fortran 90 tools for structural
characterization of porous materials. The calculated
properties include accessible surface area, porosity, pore
size distribution, maximum pore size and pore limiting
diameter. A source code and a pre-compiled MS Windows
version are available.

RASPA 2.0
https://github.com/numat/RASPA2
Molecular Software Package for Adsorption and Diffusion in
(Flexible) Nanoporous Materials
annaqz 发表于 Post on 2022-5-23 10:25:34
iniway 发表于 2022-5-22 01:34
PSD有大量现成的软件可以用,zeo++等,比MS好用

哦哦,原来如此。感谢回复!除了zeo++,还有什么软件呢?
iniway 发表于 Post on 2022-5-22 01:34:52
annaqz 发表于 2021-11-4 17:31
社长,请问一下,Multiwfn能否实现孔径分布曲线(PSD)的绘制呢?而且为什么同样cif文件,MS使用Connolly s ...

PSD有大量现成的软件可以用,zeo++等,比MS好用
sobereva 发表于 Post on 2021-11-4 22:15:50
annaqz 发表于 2021-11-4 17:31
社长,请问一下,Multiwfn能否实现孔径分布曲线(PSD)的绘制呢?而且为什么同样cif文件,MS使用Connolly s ...

不能
我不清楚M$怎么算的,没用过
annaqz 发表于 Post on 2021-11-4 17:31:01
社长,请问一下,Multiwfn能否实现孔径分布曲线(PSD)的绘制呢?而且为什么同样cif文件,MS使用Connolly surface,半径1.3得出的结果,和Multiwfn得到的free volume差异很大呢?
sobereva 发表于 Post on 2021-9-15 10:35:07
indec 发表于 2021-9-15 06:04
太好了!
社长未来有打算支持描述 isolated system (比如只给 .xyz 文件)空腔吗?类似于对 C60 等笼状体 ...

有专门的文章
使用Multiwfn可视化分子孔洞并计算孔洞体积
http://sobereva.com/408http://bbs.keinsci.com/thread-9331-1-1.html
indec 发表于 Post on 2021-9-15 06:04:16
太好了!
社长未来有打算支持描述 isolated system (比如只给 .xyz 文件)空腔吗?类似于对 C60 等笼状体系内腔的描述。

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