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求助计算金属配合物的Ir-N键能和键解离能的步骤

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发布时间: 2021-11-2 17:43

正文摘要:

各位老师和同行们好, 这几天在论坛学习了一下关于键能和键解离能的计算方法,我举例描述一下,麻烦大家帮我看看有没有什么错误,先谢谢大家了。以Ir(ppy)3为例,计算Ir-N键的键能和键解离能: 1. 首先将Ir(pp ...

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sobereva 发表于 Post on 2021-11-4 14:18:55
seantan521 发表于 2021-11-4 11:32
感谢sob老师的详细答复,有点了解了。
那如果断键之后,分子被分成两个片段的话,是不是就直接分 ...


看你的目的,是要算断三个键对应的平均键能,还是断第一个键的键能。断第1、2、3个的时候对应的键能肯定都是不一样的
seantan521 发表于 Post on 2021-11-4 11:32:02
sobereva 发表于 2021-11-3 00:06
焓等热力学量的计算:
使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据
http://sobereva.com/ ...

感谢sob老师的详细答复,有点了解了。
那如果断键之后,分子被分成两个片段的话,是不是就直接分别计算两个片段即可?通过旋转破坏某个键做限制性优化,是不是主要适用于本帖提到的这种特殊情况?
还有一个问题,计算本例中的Ir-N键键能,断开所有三个Ir-N键求差后除以3是不是比只断开一个Ir-N键要计算的更准确一点?
sobereva 发表于 Post on 2021-11-3 00:06:43
焓等热力学量的计算:
使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据
http://sobereva.com/552http://bbs.keinsci.com/thread-17494-1-1.html

没有严格的Ir-N键键能的计算方法。视具体结构而定,看看能不能把配体转一下只让Ir-N键被破坏,然后固定二面角做个限制性优化,对最终结构算个高精度单点,和原先结构的高精度单点求差得到Ir-N键键能。
参考
在Gaussian中做限制性优化的方法
http://sobereva.com/404http://bbs.keinsci.com/thread-9022-1-1.html

如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,避免有任何歧义,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题“计算金属配合物的键能和键解离能的步骤”改了,以后务必注意

seantan521 发表于 Post on 2021-11-2 19:06:22
zjxitcc 发表于 2021-11-2 18:04
DFT计算不依赖于连接关系,只依赖于原子间的相对位置,只要原子间距离、角度不变,无论你把它设置成“看上 ...

感谢老师的指导,看来是犯了很基础的错误,一下子理解了很多。

那么,在计算比如图中这个结构的Ir-N键的键能时,应该怎么做才正确呢?

zjxitcc 发表于 Post on 2021-11-2 18:04:37
本帖最后由 zjxitcc 于 2021-11-2 18:09 编辑

DFT计算不依赖于连接关系,只依赖于原子间的相对位置,只要原子间距离、角度不变,无论你把它设置成“看上去没有实线、虚线连接”、“看上去单键”、“看上去双键”,结果都是一样的。所以如果你是在GaussView里这么操作的话,E0=E1,不用算也知道。你甚至可以在GaussView里设成三重键、四重键或更多,这些仅仅是显示效果,对计算无影响,因为计算压根不会用到这些信息。看sob老师这篇博文了解基本知识《谈谈原子间是否成键的判断问题》http://sobereva.com/414

焓 在你做opt freq任务后输出文件里就有(注意这不是生成焓),自己搜一下就行了。

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