函数与激情 发表于 2021-11-3 19:47
抱歉，问题可能找到了，配体是带单个电子的，不是电中性，整体不该是+8价，这应该是结构坍塌的原因。

请问电荷和自旋应该设置成多少，我也需要算ZIF8

函数与激情 发表于 2021-11-4 09:44
没有冻结原子，不是一个完整的晶胞，结构你可以看我的附件cc.xyz

好的，谢谢。我自己也常常拿个片段出来跑。跑着跑着 散了

renzhogn424 发表于 2021-11-4 08:47
请问一下，用xtb6.3.2优化非周期的时候，你冻结边缘原子么？？还是抠出一个晶胞直接优化？

没有冻结原子，不是一个完整的晶胞，结构你可以看我的附件cc.xyz

请问一下，用xtb6.3.2优化非周期的时候，你冻结边缘原子么？？还是抠出一个晶胞直接优化？

函数与激情 发表于 2021-11-3 19:47
抱歉，问题可能找到了，配体是带单个电子的，不是电中性，整体不该是+8价，这应该是结构坍塌的原因。

我就想不应该有问题，去年用xtb算过ZIF8的团簇是OK的，这种问题多半是电荷/自旋没搞对

抱歉，问题可能找到了，配体是带单个电子的，不是电中性，整体不该是+8价，这应该是结构坍塌的原因。

丁越 发表于 2021-11-3 14:26
你到底是要优化晶胞还是要优化结构？看你的意思应该是属于优化晶胞，改成CELL_OPT。
另外优化晶胞把这个搞 ...

谢谢回复，我是优化结构，晶胞也尝试优化过，依然会散掉。

wth1219 发表于 2021-11-3 12:12
根据个人使用经验提供两点建议：
1. 周期性边界条件下的计算中盒子的a、b两边似乎不足以消除镜像之间的相 ...

谢谢回复，a,b两边的盒子大小应该是没有问题的，和实验上的cif文件中的尺寸几乎相当，而且化合价0价的情况下优化出来的情况是和气相中的情况也是较为类似的，+8价就会突然坍塌。

你到底是要优化晶胞还是要优化结构？看你的意思应该是属于优化晶胞，改成CELL_OPT。
另外优化晶胞把这个搞成类似于Slab模型干什么，ABC得是晶胞边长。MOF的话a~15埃就够了，不够的话下面的过程在多个扩胞（-9,3）。

将zif-8的cif载入Multiwfn
cp2k
-1
4
3
2
4
5
0
就ok了

根据个人使用经验提供两点建议：
1. 周期性边界条件下的计算中盒子的a、b两边似乎不足以消除镜像之间的相互作用；
2. CP2K也可以开展非周期性边界条件下的计算，如果使用POISSON_SOLVER MT的话要求盒子足够大。