计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

求助xtb任务不报错中断退出

查看数: 2780 | 评论数: 4 | 收藏 Add to favorites 0
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
发布时间: 2021-12-19 17:48

正文摘要:

在Linux系统上提交高斯和xtb任务,总是算到一半中断,输出文件并没有报错,而系统给发了一封提示邮件(You have mail in /var/spool/mail/root)。邮件最后部分贴在下面,麻烦各位大佬帮我看看是什么问题,感谢!~ ...

回复 Reply

luzujia 发表于 Post on 2021-12-19 21:36:56
sobereva 发表于 2021-12-19 20:18
连Gaussian也这样,应该是运行环境的事。能重装尝试重装,装个CentOS 8 stream

好的,谢谢社长!
sobereva 发表于 Post on 2021-12-19 20:18:15
连Gaussian也这样,应该是运行环境的事。能重装尝试重装,装个CentOS 8 stream
luzujia 发表于 Post on 2021-12-19 18:32:01
sobereva 发表于 2021-12-19 18:05
没细节没法说
xtb对什么体系怎么跑的任务、xtb具体版本、操作系统,这都是和当前问题直接相关的信息全都不 ...

抱歉社长,是我没说清楚。操作系统是Centos 7.5.1804,高斯版本是g16C01,xtb版本是6.4.1。高斯算小分子可以正常结束,稍大体系(30个原子,优化频率分析 b3lyp/6-31g*)就中断,输出文件里没有报错信息;xtb的任务是重复社长您搜索remdesivir构象的md任务,也是算到一半中断,打开轨迹文件发现也输出了七八帧。我感觉应该是系统的问题,所有就没有注意描述计算细节。
sobereva 发表于 Post on 2021-12-19 18:05:03
没细节没法说
xtb对什么体系怎么跑的任务、xtb具体版本、操作系统,这都是和当前问题直接相关的信息全都不交代

仔细看此文
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-14 04:29 , Processed in 0.170397 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list