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[Linux] 求助xtb任务不报错中断退出

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在Linux系统上提交高斯和xtb任务,总是算到一半中断,输出文件并没有报错,而系统给发了一封提示邮件(You have mail in /var/spool/mail/root)。邮件最后部分贴在下面,麻烦各位大佬帮我看看是什么问题,感谢!~


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发表于 Post on 2021-12-19 18:05:03 | 只看该作者 Only view this author
没细节没法说
xtb对什么体系怎么跑的任务、xtb具体版本、操作系统,这都是和当前问题直接相关的信息全都不交代

仔细看此文
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-12-19 18:32:01 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-12-19 18:05
没细节没法说
xtb对什么体系怎么跑的任务、xtb具体版本、操作系统,这都是和当前问题直接相关的信息全都不 ...

抱歉社长,是我没说清楚。操作系统是Centos 7.5.1804,高斯版本是g16C01,xtb版本是6.4.1。高斯算小分子可以正常结束,稍大体系(30个原子,优化频率分析 b3lyp/6-31g*)就中断,输出文件里没有报错信息;xtb的任务是重复社长您搜索remdesivir构象的md任务,也是算到一半中断,打开轨迹文件发现也输出了七八帧。我感觉应该是系统的问题,所有就没有注意描述计算细节。

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发表于 Post on 2021-12-19 20:18:15 | 只看该作者 Only view this author
连Gaussian也这样,应该是运行环境的事。能重装尝试重装,装个CentOS 8 stream
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-12-19 21:36:56 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-12-19 20:18
连Gaussian也这样,应该是运行环境的事。能重装尝试重装,装个CentOS 8 stream

好的,谢谢社长!

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