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柔性扫描的键角该如何设置？

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日暮知心

发布时间: 2022-2-12 12:06

正文摘要:

本帖最后由日暮知心于 2022-2-12 12:07 编辑比如说1、2、3原子构成一个环，我想让1逐渐远离键2-3，按照标准输入格式应该无法实现吧？怎样才能像GV里面那样可以固定2、3原子不动而改变键角∠213？谢谢各位老师 ...

回复 Reply

sobereva 发表于 Post on 2022-2-15 05:58:50

日暮知心发表于 2022-2-14 11:05
ts试过很多遍了，都找不到，而且此体系吸附反应剧烈。

我们这目前只有G09，是不是用不了GIC了

是

日暮知心 发表于 Post on 2022-2-14 11:05:21

sobereva 发表于 2022-2-14 04:55
先直接用opt=TS找过渡态，试几个过渡态初猜，如果都找不到，再考虑柔性扫描
可以用G16的GIC，要求两个部 ...

ts试过很多遍了，都找不到，而且此体系吸附反应剧烈。

我们这目前只有G09，是不是用不了GIC了

sobereva 发表于 Post on 2022-2-14 04:55:50

日暮知心发表于 2022-2-13 15:38
好的，我以后注意。
如图，我想作一个反应中心为过氧环氧化物解吸过程的柔性扫描，以验证过渡态的存在性 ...

先直接用opt=TS找过渡态，试几个过渡态初猜，如果都找不到，再考虑柔性扫描
可以用G16的GIC，要求两个部分的几何中心距离逐渐远离，详见下文GIC部分
详谈使用Gaussian做势能面扫描
http://sobereva.com/474（http://bbs.keinsci.com/thread-12660-1-1.html）

共和国面壁者 发表于 Post on 2022-2-13 18:36:28

本帖最后由共和国面壁者于 2022-2-13 18:42 编辑

http://sobereva.com/474对你可能有帮助。

sobereva 发表于 Post on 2022-2-13 03:21:56

画个示意图，说清楚到底想要干嘛

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充，应直接编辑原帖，不要通过回帖进行补充，这点在置顶的新社员必读贴里明确说了。

wzkchem5 发表于 Post on 2022-2-12 17:31:35

“固定2、3原子不动而改变键角∠213”这个定义不明确，单固定2、3的位置和∠213键角不能唯一确定原子1的位置。
先得明确定义你的需求，确定你给的限制可以唯一确定原子1的位置

日暮知心 发表于 Post on 2022-2-12 15:18:21

本帖最后由日暮知心于 2022-2-12 15:50 编辑

我想过用冻结，可是实际上2-3键长会缩短一点点。或者我让1同时远离2和3？

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