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结合gentor利用schrodinger python api进行快速二维二面角扫描

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发布时间: 2022-3-5 17:10

正文摘要:

本帖最后由 wangzhehyd 于 2022-3-5 19:50 编辑 演示分子为ACE-ALA-NME.xyz,结构如下图所示

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wangzhehyd 发表于 Post on 2022-3-7 14:00:21
greatzdk 发表于 2022-3-7 09:58
为什么3D图中有一片缺口?是没扫到吗?
为什么用schrodinger的opls4?gromacs可以用opls4嘛?

缺口是gentor生成初始构象的时候排除一部分不合理构象导致的
opls4加密的,其他程序应该用不了。
greatzdk 发表于 Post on 2022-3-7 09:58:18
为什么3D图中有一片缺口?是没扫到吗?
为什么用schrodinger的opls4?gromacs可以用opls4嘛?

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