轴手性化合物旋转能垒计算，跑完过渡态后IRC只有两个点

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发布时间: 2022-3-20 11:38

本帖最后由 MoriyaSuwako 于 2022-3-21 14:25 编辑各位老师好！我希望计算图1中轴手性化合物对应粉色C-C键的旋转能垒，首先是用PM6对其进行了柔性扫描后得到图2，并将图二中两个能量极大点认为是旋转过渡态，并 ...

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dfavor 发表于 Post on 2023-7-4 22:37:37

你好，请问你这个只跑一个点的问题解决了吗，我最近也遇到了类似的问题想请教一下

ionexchangeC 发表于 Post on 2022-3-22 17:36:36

尝试IRC=stepsize=30

sai77 发表于 Post on 2022-3-22 15:40:12

IRC也用calcall关键词，stepsize再设大些，20或者30
泛函用M062X感觉更好些

另外，你这个化合物是不是有2根手性轴

ionexchangeC 发表于 Post on 2022-3-22 13:24:49

本帖最后由 ionexchangeC 于 2022-3-22 13:26 编辑

IRC也要用int=ultrafine补充：不过这是G16默认设定，应该不是导致问题的原因

MoriyaSuwako 发表于 Post on 2022-3-21 14:28:18

ionexchangeC 发表于 2022-3-20 16:54
我认为你过渡态都没找对。可否上传输出文件？

附件已经上传，我也认为过渡态没有找对，我是通过柔性扫描C-C键，选取能量最高点作为过渡态。请问应该怎样选取合适的过渡态？还是我应当在当前选取的这个结构附近适当的进行调整即可？

ionexchangeC 发表于 Post on 2022-3-20 16:54:09

我认为你过渡态都没找对。可否上传输出文件？

wzkchem5 发表于 Post on 2022-3-20 16:43:16

参见http://sobereva.com/400

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