求助g_mmpbsa得出的静电力和范德华力异常

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发布时间: 2022-3-20 18:08

目的：计算两种蛋白在某阶段的结合能变化出现的问题：g_mmpbsa得到的静电力和范德华力的文件中，两种蛋白单独的静电力和范德华力都是零，这是哪里出了问题？希望得到各位老师的解答！谢谢！

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Tyzhang 发表于 Post on 2022-3-21 10:25:16

sobereva 发表于 2022-3-21 06:58
尝试用https://valdes-tresanco-ms.github.io/gmx_MMPBSA/这个做MMPBSA

好的。麻烦再请问sob老师一个问题，我图上最后两列不同时间点的静电力彼此差异很大，这种情况属于正常吗？是不是跟我的轨迹处理有关系？我是正十二面体盒子对轨迹进行了-pbc mol -center处理

sobereva 发表于 Post on 2022-3-21 06:58:17

尝试用https://valdes-tresanco-ms.github.io/gmx_MMPBSA/这个做MMPBSA

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