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[GROMACS] 求助g_mmpbsa得出的静电力和范德华力异常

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目的:计算两种蛋白在某阶段的结合能变化
出现的问题:g_mmpbsa得到的静电力和范德华力的文件中,两种蛋白单独的静电力和范德华力都是零,这是哪里出了问题?
希望得到各位老师的解答!谢谢!

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发表于 Post on 2022-3-21 06:58:17 | 只看该作者 Only view this author
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-21 10:25:16 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-3-21 06:58
尝试用https://valdes-tresanco-ms.github.io/gmx_MMPBSA/这个做MMPBSA

好的。麻烦再请问sob老师一个问题,我图上最后两列不同时间点的静电力彼此差异很大,这种情况属于正常吗?是不是跟我的轨迹处理有关系?我是正十二面体盒子对轨迹进行了-pbc mol -center处理

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