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.edr文件中关于分子间相互作用力的选项选择问题

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Rosefinch

发布时间: 2022-3-21 12:20

正文摘要:

我想利用gmx计算一下有机分子晶体内部分子间的相互作用力，但对于是否要考虑1-4相互作用力不是很清楚，想请问一下如果想获得总的分子间的相互作用力是不是5+6+7+8+9

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sobereva 发表于 Post on 2022-3-22 08:36:19

Rosefinch 发表于 2022-3-21 15:52
谢谢sob老师，那请问氢键之间的相互作用是包含在LJ里面了吗？以及一般分析分子间相互作用是同时考虑LJ以 ...

一般强度的氢键主要本质是静电作用，看下文，显然主要靠原子电荷描述的库仑相互作用体现
透彻认识氢键本质、简单可靠地估计氢键强度：一篇2019年JCC上的重要研究文章介绍
http://sobereva.com/513（http://bbs.keinsci.com/thread-14600-1-1.html）

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Rosefinch 发表于 Post on 2022-3-21 15:52:57

sobereva 发表于 2022-3-21 13:24
1-4是分子内的，分子间1-4作用必然为0

谢谢sob老师，那请问氢键之间的相互作用是包含在LJ里面了吗？以及一般分析分子间相互作用是同时考虑LJ以及Coul嘛？

sobereva 发表于 Post on 2022-3-21 13:24:52

1-4是分子内的，分子间1-4作用必然为0

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