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计算考虑受阻转子时的配分函数求助

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发布时间: 2022-4-10 11:24

正文摘要:

各位老师好, 目前我有以下两个问题:1、 我在论坛上看到Gaussian可以用freq=hinderedrotor 直接给出考虑受阻转子下的分配函数。我在算过渡态的配分函数写的关键词是这样的:freq=hinderedrotor m062x/6-311G(d,p)&n ...

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motorL 发表于 Post on 2024-3-6 22:20:23
兄弟,请问你第一个问题解决了吗?
dantevinsky 发表于 Post on 2022-4-12 09:27:25
bxpu 发表于 2022-4-11 09:11
谢谢老师的回答!
  我对于这两种方法的理解是:
   第一种方法:freq=hinderedrotor 是考虑内转动计算出 ...

实质上不是这样,以下是个人看法,仅供参考,欢迎讨论:
第一种方法是Gaussian基于几种特定的扭转模型给出来的配分函数计算结果(它们规避了1D hindered rotor中所需要的扭转势能面扫描)。即便是进行了扭转势能面描扫的1D hindered rotor,它的仍然假设扭转之间是完全分离独立考虑的。但由于含有多个扭转的flexible体系中扭转之间经常耦合,1D hindered rotor经常给不出很好的结果(1D hindered rotor 无法扫描出所有的conformer)。因而现在更推荐使用MS-T方法进行高精度的扭转矫正。
第二种方法也不完全对,10.1039/c0cp02644a文章中的MS-HO说的就是你的想法。对于相对低温的情况,这种方法结果不错(也很好理解),但对于高温情况,MS-HO由于简谐近似的本质,结果并不好。
sobereva 发表于 Post on 2022-4-12 03:05:41
bxpu 发表于 2022-4-11 09:11
谢谢老师的回答!
  我对于这两种方法的理解是:
   第一种方法:freq=hinderedrotor 是考虑内转动计算出 ...

第二种方法不是你想象的那么简单,还有额外的考虑。可以看看J. Chem. Theory Comput., 9, 1356-1367 (2013)里MS-T方法的介绍和讨论。
bxpu 发表于 Post on 2022-4-11 09:11:36
谢谢老师的回答!
  我对于这两种方法的理解是:
   第一种方法:freq=hinderedrotor 是考虑内转动计算出的配分函数。
   第二种方法是:不考虑内转动,将内转动的影响归纳到conformer的影响中,计算出配分函数。
  我计算速率常数,需要配分函数,我应该选用哪种方法来计算呢?
sobereva 发表于 Post on 2022-4-11 03:40:08
1 问Gaussian官方


2 这和hinderedrotor没有可比性,目的完全不一样

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