楼主你好，请问你还有QCxMS的相关资料或教程吗？

fdl 发表于 2022-6-9 10:00
如果只是比较M-15与M-18,也可以通过分别计算母离子到两个子离子的反应能垒来判断，这也是目前质谱结合理论 ...

感谢建议，上午测试了一下，确实非常耗资源，打算两种方法一起试试，QCXMS先丢集群跑着

如果只是比较M-15与M-18,也可以通过分别计算母离子到两个子离子的反应能垒来判断，这也是目前质谱结合理论计算考察碎裂过程的通用方法。如Journal of Mass Spectrometry, 2016, 51(3): 245-253. 楼上两位老师提到的QCXMS(QCEIMS的最新版本加入了ESI软电离加二级质谱碰撞诱导解离（CID）得到谱图的模式，见Journal of the American Society for Mass Spectrometry, 2021, 32(7): 1735-1751.)可以预测分子包含母离子与所有碎片离子的EI谱图与软电离下的CID谱图（CID模式目前好像只适用于正模式下的加氢峰），目前的应用集中于模拟实验标准谱库中未有化合物，可用于复杂化合物的分离与结构鉴定（如代谢组学），见Wang S, Kind T, Bremer P L, et al. Quantum Chemical Prediction of Electron Ionization Mass Spectra of Trimethylsilylated Metabolites[J]. Analytical Chemistry, 2022. QCXMS的运行需要较好的计算条件，分子越大需要越长的时间，在GFN1的条件下，30个原子左右的刚性体系，在48核的计算条件下大概也需要两天多的时间，而且得到的碎片结构与反应路径应当还需要更高精度的DFT方法验证。如果只是比较两条碎裂路径的竞争过程，还是建议参考第一篇文献的做法。

sobereva 发表于 2022-6-9 07:57
Grimme专门有公开的QCEIMS程序结合AIMD算质谱，2L是其中一篇，最早的一篇是Angew. Chem. Int. Ed. 2013, 52 ...

谢谢老师回复，我学习一下

wzkchem5 发表于 2022-6-8 21:30
可以用这里提到的方法计算
https://pubs.rsc.org/en/content/articlehtml/2017/sc/c7sc00601b

谢谢老师！我学习一下

Grimme专门有公开的QCEIMS程序结合AIMD算质谱，2L是其中一篇，最早的一篇是Angew. Chem. Int. Ed. 2013, 52, 6306 –6312，其中SI里大量细节讨论

可以用这里提到的方法计算
https://pubs.rsc.org/en/content/articlehtml/2017/sc/c7sc00601b