运行grompp进行能量最小化报错

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发布时间: 2022-6-20 21:11

请问大家，我的模拟对象是只包含R245fa分子的盒子，使用acpype转换得到.gro和.top文件后进行能量最小化，出现一个warning，如下图：

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Reisende 发表于 Post on 2022-6-21 09:16:53

sobereva 发表于 2022-6-20 23:49
可以忽略

谢谢社长

sobereva 发表于 Post on 2022-6-20 23:49:27

Reisende 发表于 2022-6-20 21:24
谢谢老师。
我刚查看了，系统提示是“System has non-zero total charge: 0.001408”，电荷量是0.001408 ...

可以忽略

Reisende 发表于 Post on 2022-6-20 21:24:49

sobereva 发表于 2022-6-20 21:18
grompp运行完之后会明确在屏幕上提示当前体系的净电荷，看具体是多少，偏离0太明显就不能忽略

谢谢老师。
我刚查看了，系统提示是“System has non-zero total charge: 0.001408”，电荷量是0.001408，这个应该是可以忽略的吧

sobereva 发表于 Post on 2022-6-20 21:18:20

grompp运行完之后会明确在屏幕上提示当前体系的净电荷，看具体是多少，偏离0太明显就不能忽略

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