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用gmx density计算膜密度前，将脂质分为头部和尾部出现错误

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发布时间: 2022-7-5 11:03

正文摘要:

本帖最后由 free3hao 于 2022-7-5 17:32 编辑请教各位大佬，使用genmixmem程序构建出磷脂双分子层，然后gmx density计算膜密度前，用gmx make_ndx将脂质分成头部和尾部，但是结构中有多种脂质分子，它们有些碳原 ...

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free3hao 发表于 Post on 2022-7-5 17:31:48

好的，谢谢了

Frozen-Penguin 发表于 Post on 2022-7-5 16:33:04

gromacs处理的优先级和你想要的不一样，而且make_ndx里面不能打括号，可以考虑设置多个group然后合并起来

例如：
4 & a N
4 & a C11
......
4 & a O14
23 | 24 | ......

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