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求助GPU版本的GMX报错nvcc fatal : Unsupported gpu architecture 'compute_30'

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发布时间: 2022-8-8 09:18

正文摘要:

1.系统ubuntu20.04,已安装gromacs2018.8目录为/sob/gmx2018.8。现在想安装编译GPU的gromacs2018,就把安装目录名重命名为gmx2018.82,然后按照教程(http://sobereva.com/457)重新安装。在make install -j出现错误 ...

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faylovesnow 发表于 Post on 2023-1-2 01:29:30
在make install -j出现错误"nvcc fatal   : Unsupported gpu architecture 'compute_30'"。这个错误可能是gpu和cuda版本不匹配的,或者是gmx版本和cuda版本不匹配。
经过测试,后续安装出现此错误的同学,首先要排查gpu驱动和cuda版本是否匹配,两者之间的对应关系去该网站 https://docs.nvidia.com/cuda/cud ... tle-resolved-issues 查询,若不满足。卸载相应驱动满足匹配要求再安装则不会报错。

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zhuceyu 发表于 Post on 2022-8-29 14:58:18
汤圆 发表于 2022-8-22 17:47
我也遇到一样的问题了,编译2019.6,把compute_30注释掉之后,出现新的报错:
: *** [src/gromacs/CMakeFi ...

修改的不是build下面的.cmake而是gromacs文件夹下的.cmake,我是这样修改后就好了,后面运行也没有报错。你也可以参考牧生发的。我的gcc是9.40,ubuntu20.04,cmake3.16.3,cuda11.7,gmx版本有2018.8gpu、2018cpu,2020cpu。我了解到的信息2018安装要求gcc和cmake不能太新。
喵星大佬 发表于 Post on 2022-8-23 06:12:40
汤圆 发表于 2022-8-22 17:47
我也遇到一样的问题了,编译2019.6,把compute_30注释掉之后,出现新的报错:
: *** [src/gromacs/CMakeFi ...

报错和nvcc无关,是gcc的问题

5磅兔22默认的gcc是11.2,太新了,不能编译2020之前的版本,换系统/编译器版本/gmx版本

有非周期性/group方式产生邻居列表/mm-gbsa需求留一个18的cpu版,其他所有情况目前建议2021.6,2022的奇奇怪怪的问题还有不少暂时不建议,不过可以尝鲜
汤圆 发表于 Post on 2022-8-22 17:47:32
本帖最后由 汤圆 于 2022-8-22 17:51 编辑

我也遇到一样的问题了,编译2019.6,把compute_30注释掉之后,出现新的报错:
: *** [src/gromacs/CMakeFiles/libgromacs.dir/build.make:2533: src/gromacs/CMakeFiles/libgromacs.dir/awh/biasparams.cpp.o] Error 1
make[3]: *** Waiting for unfinished jobs....
make[2]: *** [CMakeFiles/Makefile2:3467: src/gromacs/CMakeFiles/libgromacs.dir/all] Error 2
make[1]: *** [CMakeFiles/Makefile2:2579: CMakeFiles/check.dir/rule] Error 2
make: *** [Makefile:615: check] Error 2

我的系统是Ubuntu 22.04 LTS,cmake版本3.23.3,fftw版本 3.3.10,nvcc版本如下:
nvcc: NVIDIA (R) Cuda compiler driver
Copyright (c) 2005-2022 NVIDIA Corporation
Built on Wed_Jun__8_16:49:14_PDT_2022
Cuda compilation tools, release 11.7, V11.7.99
Build cuda_11.7.r11.7/compiler.31442593_0

202208221746185120..png (27.59 KB, 下载次数 Times of downloads: 33)

202208221746185120..png
zhuceyu 发表于 Post on 2022-8-8 13:42:03
牧生 发表于 2022-8-8 11:26
反复反复给你说了几遍,那我现在只有手把手的来了。
解压gromacs安装包mkdir buildcd buildexportCMAKE_PR ...

好的谢谢老师,修改的不是build下面的.cmake而是gromacs文件夹下的.cmake。之后修改环境之后,gmx就是启用GPU的版本了。
牧生 发表于 Post on 2022-8-8 11:26:00
本帖最后由 牧生 于 2022-8-8 11:33 编辑
zhuceyu 发表于 2022-8-8 11:00
我用whereis也没有找到gmxManageNvccConfig.cmake。请问是Cmake下面的哪个文件呢?这里的两个.cmake文件 ...
反复反复给你说了几遍,那我现在只有手把手的来了。
解压gromacs安装包
mkdir build
cd build
exportCMAKE_PREFIX_PATH=/fftw338

然后手动进入cmake文件夹,按图片操作

随手一拍,图片质量不高,但保证能看的明白





zhuceyu 发表于 Post on 2022-8-8 11:13:49
abin 发表于 2022-8-8 10:56
cuda 11.7 抛弃了对于compute_30的支持.

compute_30是什么设备呢?我是要cuda更换版本吗?重新安装低版本的然后修改环境变量?
zhuceyu 发表于 Post on 2022-8-8 11:00:03
牧生 发表于 2022-8-8 10:23
在build文件夹内,cmake文件夹下的gmxManageNvccConfig.cmake,删除compute_30这一行
可解决
不是硬件 ...

我用whereis也没有找到gmxManageNvccConfig.cmake。请问是Cmake下面的哪个文件呢?这里的两个.cmake文件都没有 compute_30的信息。

报错中Error generating
/sob/gromacs2018.8/build/src/gromacs/gpu_utils/tests/CMakeFiles/gpu_utilstest_cuda.dir//./gpu_utilstest_cuda_generated_devicetransfers.cu.o
也没有compute_30的信息。
abin 发表于 Post on 2022-8-8 10:56:47
cuda 11.7 抛弃了对于compute_30的支持.

zhuceyu 发表于 Post on 2022-8-8 10:29:59
牧生 发表于 2022-8-8 10:23
在build文件夹内,cmake文件夹下的gmxManageNvccConfig.cmake,删除compute_30这一行
可解决
不是硬件 ...

好滴,谢谢您,我试一下。
牧生 发表于 Post on 2022-8-8 10:23:37
zhuceyu 发表于 2022-8-8 10:04
这个帖子之前看过了,删除没有解决他的问题,他的问题就是我所提到cuda和gmx版本的原因。只删除文本可以 ...

在build文件夹内,cmake文件夹下的gmxManageNvccConfig.cmake,删除compute_30这一行
可解决
不是硬件原因

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zhuceyu 发表于 Post on 2022-8-8 10:04:31
本帖最后由 zhuceyu 于 2022-8-8 10:07 编辑

这个帖子之前看过了,删除没有解决他的问题,他的问题就是我所提到cuda和gmx版本的原因。只删除文本可以解决吗,是修改.cmake文件吗?确定不是软硬件的原因吗?
牧生 发表于 Post on 2022-8-8 09:35:01

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