建立晶体模型时出现的结构不正确的问题

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发布时间: 2022-8-20 11:14

我按照文献中各原子的笛卡尔坐标手动建立了晶体结构文件，应该是有96个水分子，建完之后发现虽然O和H的原子数量是对的，但是通过观察结构发现有游离的H，还有不饱和的氧，请问这种情况怎么处理呢？

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sobereva 发表于 Post on 2022-8-22 09:26:28

删掉所有氢，然后重新加氢，之后跑动力学退火或优化令氢的位置合理

牧生 发表于 Post on 2022-8-20 11:40:26

本帖最后由牧生于 2022-8-20 11:41 编辑

http://bbs.keinsci.com/thread-21676-1-1.html

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