正常引用并指出原文中存在的问题,发现问题你再去解决或完善你的文章才更有价值。 |
说句题外话,大概10年前,大家好像还普遍还不怎么做构象搜索,很多人随便画一个看起来还合理的构象算,或者取实验晶体构象算。有的画3、4个构象分别算然后取能量最低的,都已经是非常良心的了。 后来随着xtb的推出,以及随之而来的Molclus、CREST等专业构象搜索软件的普及,现在越来越多的人可以方便地做构象搜索了,而且耗时也可以接受。所以大家逐渐开始把构象搜索作为一个常备的工具,乃至workflow里不可或缺的环节来看待。目前感觉还在转型期,如果发文章不做构象搜索,仍然有不小的概率会被审稿人放过,不过再过个5年、10年看,可能做计算不做构象搜索就像用MP2/6-31G*乃至HF/6-31G*优化结构一样,被喷没有计算化学常识了。 你的工作是在他们的工作之后一段时间做的,算的比他们细是理所应当的,不存在因为怕推翻前人工作就将错就错的问题。好比,假设第一个算正丁烷的生成焓的人是个大佬,而且只考虑了trans构象,难道这就意味着后来算正丁烷生成焓的人都得故意不多算一下gauche构象然后做Boltzmann平均吗?当然gauche构象比trans构象能量高,但是gauche构象的数目是trans构象的2倍,所以在足够高温度下trans构象的平衡浓度可能不到50%,但即使这样也不构成打大佬的脸,因为大佬做计算的年代比较早,有权做得比较粗糙,而你也有道理做得比大佬更精细。 |
参与人数Participants 2 | eV +7 | 收起 理由Reason |
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星纹c | + 4 | 谢谢 |
hebrewsnabla | + 3 | 我很赞同 |
sobereva 发表于 2022-9-20 18:06 谢谢老师,我去试着安装一下molclus,我linux也是刚入门。 |
如果文章值得引用,但里面的计算明显有问题,而且跟自己当前研究的问题有关,就在引用时直接指出存在的可能的问题。 分清楚“泛函”和“函数” B3LYP/6-31G**这种档次算构象分布纯属搞笑 看 坚持使用B3LYP算有机体系能量的人的下场 http://bbs.keinsci.com/thread-12773-1-1.html 以及 molclus主页(http://www.keinsci.com/research/molclus.html)里相关教程中算构象分布都用的什么流程和级别。 要说成加DFT-D3(BJ)或简称D3(BJ),而不要说加GD3(BJ)。GD3BJ是Gaussian程序里的关键词,学术界不认 |
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