wzkchem5 发表于 2022-12-1 15:09 好的 谢谢老师 |
xiaobai1 发表于 2022-12-1 01:47 可以，但注意不要加不必要的弥散函数 |
本帖最后由 xiaobai1 于 2022-12-1 08:51 编辑 wzkchem5 发表于 2022-11-30 17:18 好的老师，那再计算高精度电子能的时候还需要用混合基组吗？我现在算高精度电子能的时候，对一般的C H O用的是M062X/6-311++g(d,p),Zn的话用了M062X/def2TZVP，不知道这样是否可行 |
xiaobai1 发表于 2022-11-30 09:27 不需要opt。自由能校正项需要算，因为即使是单原子离子，自由能校正项也不是0，只不过转动、振动贡献为0而已。 当然如果只关心结合能的相对大小，那么Zn2+这边即使不加自由能校正项也不影响结论，但问题是算出来的量就不能叫结合自由能了。 |
wzkchem5 发表于 2022-11-30 15:04 老师您好，我大概看了下那篇帖子，我也是想比较我的几个有机小分子和Zn2+的结合能力强弱，帖子里提到了用真空下的结合能作为评判标准，这里的话我的单个Zn+还需要opt+freq来得到自由能校正项吗，还是直接在高精度下计算单点能作为E（Zn2+）就可以了 |
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那一般只能算溶解自由能，或者气相里面的结合能。参见http://bbs.keinsci.com/forum.php ... =%BD%E1%BA%CF%C4%DC |
wzkchem5 发表于 2022-11-29 20:30 Zn2+ |
| 根据 EAB-EA-EB来确定结合能的大小的算法没错，但是这里的EAB，EA，EB的定义是整个团簇下优化后整体和某个片段的单点能，EA，EB不是各自独立时候优化后的单点能，结合能的计算可以参考社长的http://sobereva.com/542 |
wzkchem5 发表于 2022-11-29 17:16 这个不太好处理啊，Zn2+的六水合物未必对称性很高，水分子之间说不定都有氢键，说不清是Zn2+和水分子的作用还是水分子之间的作用。 |
xiaobai1 发表于 2022-11-29 12:38 首先，你要算的是Zn2+还是Zn原子？ |
wzkchem5 发表于 2022-11-29 17:16 嗯嗯好的老师，我现在的做法是水溶液体系里优化并得到各部分的自由能校正项，在def2TZVP基组下（也在水溶液体系里）计算各部分的单点能，然后在相加作差，老师我得第一个问题是这里的Zn是不是得在真空环境下计算，然后去算一个溶解自由能呢？其次我在算Zn和其他有机分子的结合能的时候，是不是拿掉1个H2O换成我的有机分子用同样的方法去得到结合能呢？谢谢老师 |
| 本来就应该有很大区别，因为Zn和H2O的相互作用会改变H2O分子的取向 |
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