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使用伞形采样模拟中,用gmx wham计算PMF得到反应坐标和总窗口的距离不一致

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发布时间: 2023-2-22 15:40

正文摘要:

我的想使用伞形采样做的是一个CH4分子通过石墨烯孔的自由能,我总共设置了30个窗口,每个窗口间隔0.1nm,计算得到的PMF感觉不对,这个反应坐标距离是少了吗?为什么不是3nm呢?

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