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关于MESS软件输入文件中受阻转子参数计算问题

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发布时间: 2023-2-26 20:35

正文摘要:

各位老师好,本人拟采用MESS计算化学反应速率,该软件的输入文件涉及到受阻转子的一些参数(如图1所示,同时图2对应分子图),想请教一下图中一些参数通过什么方法/软件获得的? 1、判断是否是受阻转子的标准是否是 ...

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dantevinsky 发表于 Post on 2023-2-27 18:55:31
1. “判断是否是受阻转子的标准是否是转动频率小于100cm-1?” 否,一般情况下,有几个单键我们就会设定几个受阻转子。(对于你这个体系也是这样,只有一个围绕1-7键轴的转动);
2.“图中”Symmetry“参数指的是转动组的对称性嘛?怎么判断的?” 是的,我不认为这里的symmetry是上面那篇文献中展示的内容,文献中说的是反应速率计算中涉及到的对称数概念,而这里的应该是指受阻转子配分函数计算公式中的对称数,也就是转动组的对称性。其是按照对称性相对较大的那一组来设定的,比如说你这里就是苯环那边围绕1-7轴的对称性,即2;
3.“图中”Potential“参数是通过柔性扫描获得的嘛?柔性扫描是否需要将其余不转动的原子冻结?”是的,不需要。实际上这个柔性扫描是否要冻结,现在学术上也没有确切的说法,Klippenstein教授在Faraday Discussion上的总结中也提到了这一点。不过你这里可以不冻结,然后在文章中直说即可。

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594yy 发表于 Post on 2023-2-27 16:42:51
王二葛 发表于 2023-2-27 08:51
关于对称数,请参考这篇保姆式教程:
https://link.springer.com/article/10.1007/s00214-007-0328-0

感谢指教,我去学习一下。
王二葛 发表于 Post on 2023-2-27 08:51:10
关于对称数,请参考这篇保姆式教程:
https://link.springer.com/article/10.1007/s00214-007-0328-0

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