计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

通过Linux系统使用长程校正泛函工具optDFTw时遇到“未找到命令”问题如何解决?

查看数: 1508 | 评论数: 8 | 收藏 Add to favorites 0
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
发布时间: 2023-4-3 20:23

正文摘要:

今天使用Linux系统做优化w的区间分离泛函时遇到这样的报错,查找到问题是给出的数据少于程序所需的数据,但是我不知道应该如何修改。程序输出的out文件为空。 请老师帮忙看一下我的操作哪里有问题? 谢谢!

回复 Reply

莫等闲 发表于 Post on 2023-4-5 19:55:10
wzkchem5 发表于 2023-4-4 21:36
但凡自行解决了问题,一定要把解决方案发上来,这样以后的人遇到同样问题可以直接看帖解决而不用问你。

好的
就是用pbs作业提交,执行命令为./optDFTw > xx.out,我之前没有写“> xx.out”是得不到记录优化后的w值的文件
wzkchem5 发表于 Post on 2023-4-4 21:36:22
莫等闲 发表于 2023-4-4 11:17
问题解决了,十分感谢

但凡自行解决了问题,一定要把解决方案发上来,这样以后的人遇到同样问题可以直接看帖解决而不用问你。
莫等闲 发表于 Post on 2023-4-4 18:17:34
xuhj199508 发表于 2023-4-4 10:41
你可能只把g09的环境变量写入到pbs脚本里了,没在.bashrc中设定。先试一下g09  xx.out 能否正常运行。

问题解决了,十分感谢
莫等闲 发表于 Post on 2023-4-4 11:12:56
xuhj199508 发表于 2023-4-4 10:41
你可能只把g09的环境变量写入到pbs脚本里了,没在.bashrc中设定。先试一下g09  xx.out 能否正常运行。

我在PATH中加入了/opt/g09
现在报错信息变成了“No executablefor file l1.exe”
xuhj199508 发表于 Post on 2023-4-4 10:41:06
莫等闲 发表于 2023-4-4 09:41
我现在是可以用pbs作业提交g09的计算请求并得到结果。
那出现这种情况是不是可能没有权限直接调用g09?

你可能只把g09的环境变量写入到pbs脚本里了,没在.bashrc中设定。先试一下g09 <xx.gjf> xx.out 能否正常运行。
莫等闲 发表于 Post on 2023-4-4 09:41:39
sobereva 发表于 2023-4-4 06:14
你先确保当前机子里能用g09命令正常运行任务
如果机子里装的是Gaussian 16,用下文的G16版
优化长程校正 ...

我现在是可以用pbs作业提交g09的计算请求并得到结果。
那出现这种情况是不是可能没有权限直接调用g09?
sobereva 发表于 Post on 2023-4-4 06:14:30
你先确保当前机子里能用g09命令正常运行任务
如果机子里装的是Gaussian 16,用下文的G16版
优化长程校正泛函w参数的简便工具optDFTw
http://sobereva.com/346http://bbs.keinsci.com/thread-4100-1-1.html

如果都不知道机子装好Gaussian没有,看下文
Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http://sobereva.com/439http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1-1.html
wzkchem5 发表于 Post on 2023-4-3 22:12:18
检查PATH变量是否设置正确

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-23 08:47 , Processed in 0.168007 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list