求助：Gaussian优化有机物分子结构，和文献中结构不一样是正常的吗

查看数: 1083 | 评论数: 4 | 收藏 Add to favorites 1

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

发布时间: 2023-4-12 19:28

本帖最后由 lyrrrrr 于 2023-4-12 19:35 编辑新手小白求助：和文献中对同一分子磺胺甲恶唑利用Gaussian进行结构优化，初始构型利用Chem3D进行绘制，通过Gaussian b3lyp-d3/6-31g(d)优化后，和文献中的构型完全不 ...

回复 Reply

lyrrrrr 发表于 Post on 2023-4-13 10:00:43

Kmetsch 发表于 2023-4-12 20:20
单从你的输入文件里好像没看到gd3bj，不过这个结构可能影响不大

谢谢Kmetsch老师，已经解决啦

lyrrrrr 发表于 Post on 2023-4-13 09:57:13

sobereva 发表于 2023-4-12 20:09
要有构象搜索的概念
看这些了解常识和构象搜索做法

谢谢sobereva老师，确实是我的基础构型有问题（虽然我还是没看出来问题在哪里），目前利用mol文件进行计算后已没问题。

Kmetsch 发表于 Post on 2023-4-12 20:20:53

单从你的输入文件里好像没看到gd3bj，不过这个结构可能影响不大

sobereva 发表于 Post on 2023-4-12 20:09:10

要有构象搜索的概念
看这些了解常识和构象搜索做法

构型和构象搜索程序Molclus主页：http://www.keinsci.com/research/molclus.html
使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-577-1-1.html
gentor：扫描方式做分子构象搜索的便捷工具
http://bbs.keinsci.com/thread-2388-1-1.html
将Confab或Frog2与Molclus联用对有机体系做构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-20063-1-1.html
使用Molclus结合xtb做的动力学模拟对瑞德西韦(Remdesivir)做构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-16255-1-1.html

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register