求助：膜蛋白体系在加热后的平衡步骤中水散开是什么原因？

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发布时间: 2023-4-26 17:47

在amber20软件中进行最小化、加热、平衡时，发现膜两边水会散开是什么原因呢？新手求助，还请各位老师不吝赐教~ 设置了周期盒子：set com box {130 130 120} 平衡in ...

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sobereva 发表于 Post on 2023-4-26 23:40:44

处理轨迹的周期边界条件记录方式，把原子卷到盒子里就完了。cpptraj、VMD等都能干（VMD里用pbc wrap -all命令）

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