wzkchem5 发表于 2024-10-22 15:52 原来如此,那结合柔性扫描结果应该能说明不存在过渡态了,谢谢老师指点 |
Orlea 发表于 2024-10-22 08:35 很有可能,因为水分子和氢氧根的亲核性差别极大,反应的热力学有利程度会差很多,完全有可能导致其中一个有能垒、而另一个则没有。 |
wzkchem5 发表于 2024-10-20 13:27 老师,我看了一篇文献,同样的机理,反应物是水分子,他有相应的过渡态和能垒,如果把水分子换成氢氧根,有可能反应是无垒反应吗? |
wzkchem5 发表于 2024-10-20 18:23 明白了,谢谢老师,我再学习学习柔性扫描相关的内容 |
Orlea 发表于 2024-10-20 08:16 做柔性扫描 具体做法在这个论坛一搜就知道 |
wzkchem5 发表于 2024-10-20 13:27 请教一下老师如何判断是否是无垒反应呢,如果一个反应有能垒,找到过渡态就可以,如果他无垒是否需要一些过程来做证明?谢谢老师 |
Orlea 发表于 2024-10-20 04:21 先确定是不是无垒反应 |
wzkchem5 发表于 2024-7-2 16:27 请问老师,最近我在搜索氢氧根加成相关的反应时,考虑了显式水分子,不过做了几个初猜都没有搜到过渡态,做柔性扫描任务结束之后,scan还是没办法点击,想请教一下老师,这种带电荷的体系加水分子的时候有哪些需要注意的呢,谢谢 ![]() |
wzkchem5 发表于 2024-7-2 16:27 谢谢wang老师,我再认真消化一下~ |
李绾绾 发表于 2024-7-2 09:21 (1)可能有也可能没有,而且和所用溶剂也有关。对 (2)对 (3)有机物的电荷和自旋多重度是不是0、1不能一概而论,要结合你的具体有机物判断 (4)不能,因为gaussview是假设电荷为0、并且假设自旋多重度只能是1、2,这样给的默认值,需要人来判断默认值对不对,不能以为gaussview很聪明 (5)仔细阅读http://sobereva.com/327 |
wzkchem5 发表于 2023-6-5 01:49 老师您好,借助这个问题想向您请教一下,(1)氢氧根夺一个有机物的叔氢(三级碳上的H),或者说氢氧根和酸反应,这种离子型的反应有过渡态嘛,是不是应该比较这个有机物和酸电离出H的难易程度来判断和氢氧根反应的难易程度呢?(2)如果是做柔性扫描,做氢氧根接近叔氢过程中的能量最高点,如果出现这个点,说明就是有过渡态,依然要按照TS的方式继续去优化?(3)此时去优化TS时按照片段组合波函数的方法,给TS中的氢氧根设置charge,spin分别为-1 1,有机物设置0 1,总合为-1 1,这样去做TS是对的是不?(4)我按照(3)的方式优化的结果,另存为gjf显示总合-1 1,有机物 0 1,但氢氧根变成了0 2,这能说明氢氧根在反应过程变成了自由基吗?(5)另外,为什么做氢氧根的反应需要设置显示溶剂呢,显示溶解的作用是参与反应还是什么呢?谢谢老师,打扰您了,希望得到您的指导~ |
wzkchem5 发表于 2023-6-5 01:49 哦!对,我犯蠢了,感谢 |
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电荷设错了 另外,不要用3-21G,至少也得用6-31G(d)(现在即使6-31G(d)都逐渐不被人接受了);此外必须做显式溶剂化 |
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