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动力学算的PMF的自由能垒和静态计算的势能面上的电子能垒的区别是啥

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gehan

发布时间: 2023-6-9 10:50

正文摘要:

本帖最后由 gehan 于 2023-6-9 10:50 编辑最近由于想学习一下有关能垒方面的知识，了解到通过cp2k计算的AIMD可以通过VMD软件计算得到体系中任意两种元素的径向分布函数（rdf），接着又学习到可以根据得到的rdf数 ...

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gehan 发表于 Post on 2023-6-10 21:05:22

sobereva 发表于 2023-6-10 11:31
1、2
通过动力学得到PMF可以充分表现温度/压力条件、溶剂环境、动态效应、热力学效应，可以直接对液态体 ...

感谢社长的详细解答

gehan 发表于 Post on 2023-6-10 21:04:04

fhh2626 发表于 2023-6-9 14:46
自由能面中还包括熵贡献。使用势能面分析反应是在没有办法准确估计熵贡献前提下的一个近似

谢谢您的回答

sobereva 发表于 Post on 2023-6-10 11:31:41

1、2
通过动力学得到PMF可以充分表现温度/压力条件、溶剂环境、动态效应、热力学效应，可以直接对液态体系进行计算，根据PMF得到的自由能垒也因此能全面体现这些因素，这比量化或第一性原理基于简化的模型静态地计算过渡态和势垒对各种因素考虑得明显更周全，也更能解释实际问题。

3 不同场合的活化能有不同含义和获得方式。通常是指阿仑尼乌斯公式公式拟合出来的，看下文
谈谈如何通过势垒判断反应是否容易发生
http://sobereva.com/506（http://bbs.keinsci.com/thread-14313-1-1.html）

4 能

fhh2626 发表于 Post on 2023-6-9 14:46:18

自由能面中还包括熵贡献。使用势能面分析反应是在没有办法准确估计熵贡献前提下的一个近似

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